A legfontosabb különbség a cisz és a transz splicing között az, hogy a cisz splicing egy olyan intramolekuláris mechanizmus, amely eltávolítja az intronokat és csatlakozik az ugyanazon RNS-transzkriptumban lévő exonokhoz, míg a transz-splicing egy olyan intermolekuláris mechanizmus, amely eltávolítja az intronokat vagy outronokat és csatlakozik azokhoz az exonokhoz, amelyek nem ugyanabban az RNS-transzkriptumban vannak.
Az RNS-splicing az RNS-feldolgozás egyik formája a fehérjeszintézis előtt. Ebben a folyamatban egy újonnan készített pre-mesenger RNS transzkriptum egy érett hírvivő RNS-vé alakul. Az érett hírvivő RNS segít fehérjemolekula előállításában. Az RNS splicing során az intronokat (nem kódoló régiókat) eltávolítják, és az exonokat (kódoló régiók) összekapcsolják, hogy érett mRNS-t kapjanak. A cisz és a transz splicing az RNS splicing mechanizmusának két típusa.
Mi az a Cis Splicing?
A cis splicing egy olyan intramolekuláris mechanizmus, amely eltávolítja az intronokat, és csatlakozik az azonos RNS-transzkriptumban lévő exonokhoz. A normál cisz-splicing egyetlen RNS-molekulát dolgoz fel. A cisz-splicing a pre-mRNS tipikus illesztési folyamata, amelyet spliceoszómák hajtanak végre. Az intronban egy donorhely (az intron 5'-vége), egy elágazási hely (az intron 3'-végének közelében) és egy akceptorhely (az intron 3'-vége) rendkívül nélkülözhetetlen a splicinghez. A splice donor hely egy invariáns GU szekvenciát tartalmaz az intron 5' végén. Az intron 3' végén lévő splice akceptor hely invariáns AG szekvenciával rendelkezik. Az AG szekvenciától felfelé van egy pirimidin régiónak nevezett régió (polipirimidin traktus). A polipirimidin traktustól távolabb van egy elágazási pont, amely egy adenozin nukleotidot tartalmaz. Ez a nukleotid részt vesz a lariátképzésben.
01. ábra: Cis és transz illesztés
A fő spliceoszómák az U1, U2, U4, U5 és U6. Közülük nagyon fontos az U1 és az U2. A cisz-splicing során az U1 az 5’-es splicing helyhez, az U2 pedig a 3’-es splicing helyhez közeli elágazási ponthoz kötődik. Az U5/U4/U6 exonokat köt az 5’-es helyen, az U6 pedig az U2-hez. Később megjelenik a U1. Az U5 exonról intronra tolódik, az U6 pedig az 5’-es splice helyhez kötődik. Továbbá megjelenik a U4 is. Az U6/U2 katalizálja az átészterezést, így az intron 5' vége az intron A nukleotidjához ligálódik. Ez beindítja a lariaták képződését. A lariát kialakulásakor az U5 a 3'-es splice helynél köti meg az exont, és az 5'-es hely hasad. Az összeillesztés utolsó fázisában az U2/U5/U6 a lariáthoz kötve marad, és a 3’ hely hasad. Ezen kívül az exonokat ATP hidrolízissel ligálják ebben a fázisban.
Mi az a transzillesztés?
A transzsplicing egy intermolekuláris mechanizmus, amely eltávolítja az intronokat vagy outronokat, és összekapcsolja azokat az exonokat, amelyek nem ugyanazon az RNS-transzkripton belül vannak. A transzsplicing során nincs 5'-es splicing hely a pre-mRNS-molekulán az U1 fehérje kötődéséhez. Ehelyett a capped splice leader (SL) RNS transz-illesztésre kerül az outron szekvenciájára.
02. ábra: Transzillesztés
Az Outron a pre-mRNS egy régiója az 5'-sapka és a transz splice hely között. Az U2 fehérje azonban általában a 3’ splice helyhez kötődik. Az outron eltávolítása után a splice leader (SL) exon az első exonhoz kapcsolódik a pre-mRNS-en. Ezenkívül a transz-splicing egy olyan mechanizmus, amelyet bizonyos mikroorganizmusokban, például a Kinetoplastae osztályba tartozó protistákban figyeltek meg a gének expresszálására.
Mi a hasonlóság a cis és a transz splicing között?
- A cisz és a transz splicing az RNS splicing mechanizmusának két típusa.
- Mindkét mechanizmusban az intronok eltávolításra kerülnek.
- Ezenkívül mindkét mechanizmusban az exonok összekapcsolódnak, hogy érett mRNS-t képezzenek.
- Mindkét mechanizmus megtalálható az eukariótákban.
- Ezek a mechanizmusok hiányoznak a prokariótákból.
Mi a különbség a Cis és a Trans Splicing között?
A cis splicing egy olyan intramolekuláris mechanizmus, amely eltávolítja az intronokat és csatlakozik az ugyanazon RNS-transzkriptumban lévő exonokhoz, míg a transz-splicing egy olyan intermolekuláris mechanizmus, amely eltávolítja az intronokat vagy outronokat, és összekapcsolja azokat az exonokat, amelyek nem ugyanazon RNS-en belül vannak. átirat. Tehát ez a legfontosabb különbség a cis és a transz illesztés között. Ezenkívül a cisz-splicing során az intronokat eltávolítják, hogy érett mRNS-t képezzenek. Másrészt a transz splicing során az intronokat vagy outronokat eltávolítják, hogy érett mRNS-t képezzenek.
A következő infografika táblázatos formában sorolja fel a cisz és a transz illesztés közötti különbségeket egymás melletti összehasonlítás céljából.
Összefoglaló – Cis vs Trans Splicing
Az RNS-splicing az RNS-feldolgozás egyik formája a fehérjeszintézis folyamata előtt. A cisz és a transz splicing az RNS splicing mechanizmusának két típusa, amelyek az eukariótákban találhatók. A cisz-splicing egy olyan intramolekuláris mechanizmus, amely eltávolítja az intronokat, és összekapcsolja az ugyanazon RNS-transzkriptumban lévő exonokat, míg a transz-splicing egy olyan intermolekuláris mechanizmus, amely eltávolítja az intronokat vagy outronokat, és összekapcsolja azokat az exonokat, amelyek nem ugyanazon RNS-transzkriptumban találhatók. Így ezzel a cisz és transz splicing közötti különbség tárgyalása véget is ért.
