A legfontosabb különbség a növényi és állati DNS-kinyerés között az, hogy a növényi DNS-kivonás során a sejtfalat szárazjégben vagy folyékony nitrogénben való őrléssel kell megtörni, hogy a sejttartalom felszabaduljon állati DNS-kivonás során., ezt a lépést nem szükséges elvégezni, mivel az állati sejteknek nincs sejtfaluk.
A genomi DNS a növényi és állati sejtek genetikai anyaga. A genomi DNS minden egyes növény vagy állat esetében egyedi. A jó minőségű DNS DNS-kinyerése a molekuláris kutatás előfeltétele. Az élőlények DNS-ét kivonják azonosítás, betegségek diagnosztizálása, meghatározott gének és szekvenciák kimutatása, igazságügyi szakértői célok, apasági vizsgálat, genom szekvenálás, gyógyszerek kifejlesztése stb. A DNS-kivonási módszer a sejtek típusától függően változik – legyen az állati vagy növényi sejt.
Mi az a növényi DNS-kivonás?
A növényi sejtekben lévő DNS-t különböző molekuláris vizsgálatokhoz vonják ki. Szükséges az ép, tiszta genomi DNS kinyerése. Ezért különböző típusú DNS-kivonási protokollok léteznek, amelyek eltérnek az állati sejtekből származó DNS-kivonási protokolloktól. Ennek az az oka, hogy a növényi sejteknek van egy sejtfaluk, amelyet meg kell törni a sejttartalom eltávolításához.
Az extrakciót általában úgy végzik, hogy a növényi szöveteket szárazjégben vagy folyékony nitrogénben mozsártörővel őrlik. Ezután a sejtmembránokat felbontják, és a sejttartalmat extrakciós pufferbe szedik. Ez általában mosószerrel történik; SDS (nátrium-dodecil-szulfát) vagy CTAB (cetil-trimetil-ammónium-bromid) puffer. A felszabaduló DNS-t kelátképző ágens, például EDTA segítségével védik az endogén nukleázoktól. Ezenkívül a fehérjéket kloroform vagy fenol segítségével választják el a DNS-től.
01. ábra: Növényi DNS-kivonás
A növények poliszacharidokat és polifenolokat szintetizálnak, beleértve a flavonoidokat és más másodlagos metabolitokat. Ezek a vegyületek megzavarják a tiszta genomiális DNS extrakcióját. Ezért a legtöbb növényi DNS-kivonási protokoll egy másik lépést is tartalmaz, például cézium-klorid sűrűséggradiens technikát e vegyületek eltávolítására.
A legtöbb DNS-kivonási protokoll friss levélminták használatát javasolja a DNS-kivonáshoz. Egyes módszerek nem tartalmaznak veszélyes vegyi anyagokat, például folyékony nitrogént és fenolt. A CTAB (cetil-trimetil-ammónium-bromid) protokoll egy népszerű növényi DNS-kivonási protokoll, amely elősegíti a kiváló minőségű növényi genomi DNS extrakcióját. Ez egy egyszerű, biztonságos, megbízható és költséghatékony módszer a növényi DNS kinyerésére. A legtöbb egyéb módszer a CTAB módszer módosított változata.
Mi az az állati DNS-kivonás?
Az állati DNS extrakció a genomiális DNS extrakciója állati sejtekből molekuláris elemzés céljából. A növényi DNS-kivonástól eltérően az állati sejtek esetében nem szükséges a sejtfal lebontása, mivel nincs sejtfaluk. A vérsejtek a leggyakoribb állati sejtek, amelyeket különféle célokra használnak.
02. ábra: DNS-kivonás
A fenol-kloroform módszer az egyik legjobb választás a vérsejtek számára. A DNS hozama és minősége magas, ha ezzel a módszerrel vonják ki a DNS-t. Ez egy folyadék-folyadék DNS extrakciós protokoll, és ez a módszer a DNS-molekulákat az elegyedhetetlen oldatokban való oldhatóságuk alapján választja el. A fenol, a kloroform és az izoamil-alkohol a módszer három legfontosabb összetevője.
Mi a hasonlóság a növényi és állati DNS-kinyerés között?
- Mind a növényi, mind az állati DNS-kinyerés során a sejtmembránokat meg kell bontani.
- A DNS-t védeni kell az endogén nukleázoktól.
- Sőt, meg kell akadályozni a DNS elnyírását.
- Kereskedelmi készletek állnak rendelkezésre a növényi és állati DNS kinyeréséhez.
- A legtöbb növényi és állati DNS-kivonási módszer folyamatos módosításra és szabványosításra szorul.
Mi a különbség a növényi és állati DNS-kinyerés között?
A legfontosabb különbség a növényi és állati DNS-kinyerés között az, hogy a növényi DNS-kinyeréshez a növényi szövetet szárazjégben vagy folyékony nitrogénben kell őrölni, hogy megtörjék a sejtfalat, míg az állati DNS-kivonás nem igényli ezt a lépést, mivel állati eredetűek. a sejteknek nincs sejtfaluk. A CTAB módszer az egyik legjobb módszer a növényi DNS-kivonásra, míg a fenol-kloroform módszer az egyik legjobb állati DNS-kivonás.
Az alábbi infografika táblázatba foglalja a növényi és állati DNS-kinyerés közötti különbségeket.
Összefoglaló – Növényi vs állati DNS-kivonás
Különböző módszerek állnak rendelkezésre a DNS különböző sejttípusokból történő kinyerésére. Ezért a növényi DNS-kivonási protokollok eltérnek az állati sejtek DNS-kivonási protokolljaitól. A növényi DNS-kivonás a sejtfal, a sejtmembrán és a magmembrán, míg az állati DNS-kivonás a sejtmembrán és a nukleáris membrán lebontását igényli. Ennél is fontosabb, hogy az állati sejt DNS-kivonása nem igényli a sejtfalak szárazjégben vagy folyékony nitrogénben való őrléssel történő megbontását. Így ez a legfontosabb különbség a növényi és állati DNS-kivonás között.
