A fő különbség a Cosmid és a Phagemid között a benne lévő szekvenciák típusában van. A kozmid tartalmaz egy cos helyet és egy plazmidot. Ezért ez egy hibrid vektor, míg a Phagemid egy plazmid, amely az F1 fág F1 replikációs origót tartalmaz.
A kozmidokat és a fagemideket klónozási célokra használják, különösen nagyobb DNS-fragmensek klónozására. Ezeket széles körben alkalmazzák, különösen a különféle fehérjék termeléséért felelős gének klónozásában. A kozmidokat és a fagemideket vagy önmagukban replikálják plazmidként, vagy vírusrészecskékbe csomagolják, majd replikálják őket.
Mi az a kozmid?
A kozmid, amelyet hibrid plazmidnak neveznek, lambda fágrészecskékből és egy plazmidból extrahált cos helyeket tartalmaz. Ezek a cos helyek a DNS hosszú, 200 bázispáros fragmentumai. Ennélfogva összefüggő vagy ragadós végeik vannak, amelyek lehetővé teszik, hogy a plazmid beilleszkedjen a vírus DNS-ébe. Ezért a cos helyek létfontosságúak a DNS csomagolásához.
Három cos webhely van;
- cosN hely – részt vesz a DNS-szál bevágásában terminázaktivitás révén
- cosB webhely – részt vesz a terminál fenntartásában.
- cosQ hely – részt vesz a DNS DNS-ázok általi lebomlásának megakadályozásában.
01. ábra: Kozmid
Ezenkívül a kozmidok vagy egyszálú DNS-t vagy kétszálú DNS-t képesek replikálni megfelelő replikációs origót használva. A kozmidok általában antibiotikum-rezisztencia-géneket tartalmaznak, mint markereket a transzformánsok szelekciójához. Így egy kozmid alkalmazása vektorként megkönnyítheti a klónozást, és a vektor restrikciós enzimes emésztése kivonhatja ezeket a fragmentumokat.
Mi az a fágmid (phasmid)?
Phagemid, más néven Phasmid, szintén egyfajta hibrid vektor. A Phagemid egy speciális replikációs origót tartalmaz, amelyet f1 replikációs origónak neveznek. Az f1 fágból származó replikációs kivonatok f1 origója.
A Phagemid képes az egyszálú és a kétszálú DNS-t is replikálni. A replikáció történhet plazmidként, miközben független replikáción megy keresztül, vagy fágrészecskékbe csomagolhat, és végül megfertőzheti az E. coli bakteriális gazdaszervezetet. Az E coli sejtek megfertőzésekor az f1 fágnak egy pilus jelenlétére van szüksége. Ezért a nemi pilusok fontosak a Phagemids in vitro csomagolása során.
Mi a hasonlóság a Cosmid és a Phagemid között?
- Mind a Cosmid, mind a Phagemid a rekombináns DNS-technológiában használt klónozó vektorok.
- A kozmid és a phagemid képes replikálni az egyszálú és kétszálú DNS-t.
- Mindkettő a plazmidokhoz hasonlóan független replikáción megy keresztül.
- A Cosmid és a Phagemid in vitro csomagoláson eshet át, és megfertőzheti a baktériumsejteket.
- Mind a Cosmid, mind a Phagemid megfelelő replikációs origót igényel a klónozáshoz.
Mi a különbség a Cosmid és a Phagemid között?
Cosmid vs Phagemid |
|
A Cosmid egy hibrid vektor, amely cos helyet és plazmidot tartalmaz. | Phagemid egy plazmid, amely az F1 fág F1 replikációs origót tartalmaz. |
Cos webhelyek jelenléte | |
A Cos helyek jelen vannak a kozmidban, és szükségesek az in vitro csomagoláshoz. | A Cos webhelyek hiányoznak a phagemidben. |
Az F1 replikációs eredete jelenléte | |
A kozmidban a fi replikációs origó előfordulhat, vagy nem. | F1 replikációs origó jelen van a phagemidben. |
Antibiotikum-rezisztens gének jelenléte | |
Antibiotikum-rezisztens gének vannak jelen a kozmidokban, hogy azonosítsák a transzformánsokat a nem transzformánsoktól. | Az antibiotikum-rezisztens gének hiányoznak a fágamidokban. |
Az in vitro csomagolás követelményei | |
Cos webhely szükséges. | Sexpilus szükséges. |
Összefoglaló – Cosmid vs Phagemid
A Cosmid és a Phagemid a rekombináns DNS-technológiában használt klónozó vektorok. A kozmidok hibrid vektorok, amelyek speciális ragadós végeket tartalmaznak, amelyeket cos helyeknek neveznek. az in vitro csomagoláshoz szükség van ezekre a cos oldalakra. Míg a fágamidok olyan plazmidok, amelyek az f1 fágból kivont f1 replikációs origót tartalmaznak. Mind a kozmid, mind a fagemid független replikáción vagy in vitro csomagoláson mehet keresztül baktériumsejtekbe. Ezek a fontos különbségek a kozmid és a fágmid között.