Kiemelt különbség – miniműhold vs mikroműhold
Az ismétlődő DNS az élőlények genomjában újra és újra ismétlődő nukleotidszekvenciák. Az ismétlődő DNS a genomiális DNS jelentős hányadát teszi ki, és három fő típusa van: tandem ismétlődések, terminális ismétlődések és interpersed ismétlődések. A tandem ismétlődések olyan erősen ismétlődő sorozatok, amelyek megszakítás nélkül egymás mellett helyezkednek el. A gerinces genomjában a tandem ismétlődéseknek három fő típusa van. Ezek műhold DNS, mikroszatellit DNS és miniszatellit DNS. A miniszatellit egy erősen ismétlődő DNS szakasz, amely 10-100 bázispárból álló ismétlődő szekvencia sorozatból áll. A mikroszatellit az ismétlődő DNS egy szakasza, amely 1-9 bázispárból álló rövid ismétlődő szekvenciákból áll. Ezért a legfontosabb különbség a mini- és mikroműhold között az ismétlődő sorozat mérete vagy hossza.
Mi az a miniműhold?
A miniszatellit DNS a DNS egy szakasza, amely 10-60 bázispár hosszúságú, rövid DNS ismétlődő szekvenciák sorozatát tartalmazza. A miniműholdakat változó számú tandem ismétlésnek (VNTR) is nevezik. A miniműholdakat gyakran összekeverik a mikroműholdakkal. A tudósok azonban ma már az ismétlődő szekvencia mérete alapján megkülönböztetik a mini- és mikroműholdakat.
A miniszatellitek több mint 1000 helyen láthatók az emberi genomban. Ezek a rövid sorozatok gazdagok G-ben és C-ben. Egy adott miniszatelliten az ismétlődések száma nagymértékben változik az egyének között.
Az első emberi miniműholdat A. R. Wyman és R. White azonosította 1980-ban. Később Alec Jeffreys felfedezte az élőlények közötti miniműholdak kópiaszámának szélsőséges polimorfizmusát. Ezek a felfedezések a miniműholdakat ideális markerekké tették a DNS-ujjlenyomat-vételhez, a kapcsolatelemzéshez és a populációvizsgálatokhoz. A miniszatellitek hozzájárulnak a génexpresszió, a transzkripció, az alternatív splicing stb. szabályozásához is.
Mi az a mikroműhold?
A mikroszatellit a DNS olyan szakasza, amely 1-10 bázispár hosszúságú egyszerű szekvenciaismétlődésekkel rendelkezik. A mikroműholdakat rövid szekvencia ismétlődésnek (SSR) vagy egyszerű tandem ismétlésnek (STR) is nevezik. A mikroműholdaknak két típusa van, amelyeket egyszerű mikroműholdaknak és összetett mikroműholdaknak neveznek. Az egyszerű mikroműholdak csak egyfajta ismétlődő szekvenciákból állnak. Az összetett mikroműholdak egynél több típusú ismétlődésből állnak. A mikroszatellitek leggyakrabban poli A/T régiókkal rendelkeznek. A mikroszatelliták kodominánsak és bőségesek az eukarióta genomokban.
A miniműholdakhoz hasonlóan a mikroműholdak is polimorfizmust mutatnak az egyének között. Egy adott mikroszatellit esetében az ismétlődések száma egyénenként változó. Ezért a mikroműholdak genetikai markerekként is használhatók a DNS-ujjlenyomat-vételben. A mikroszatellit polimorfizmus könnyen azonosítható PCR-rel és gélelektroforézissel. A mikroszatellit szomszédos régiója erősen konzervált a rokon fajokban.
Mi a hasonlóság a miniműhold és a mikroműhold között?
- A miniszatellitek és mikroműholdak nem kódoló DNS-szekvenciák.
- Mindkettő tandem ismétlés.
- Mindkettő erősen ismétlődő sorozatokból áll.
- Mindkettő hatékony genetikai markerként használható a DNS-ujjlenyomat-vételhez.
Mi a különbség a miniműhold és a mikroműhold között?
Miniszatellit vs mikroműhold |
|
| A miniszatellitek tandem ismétlődések 10-100 bázispár közötti monomer ismétlődéssel. | A mikroszatellitek rövid tandem ismétlődések, amelyek 1-9 bázispárból álló monomer ismétlődő szekvenciákból állnak. |
| Az ismétlődő sorozat mérete | |
| A miniszatellit 10-100 bázispárból álló ismétlődő sorozatokkal rendelkezik. | A mikroszatellit rövid, 1–9 bázispáros sorozatokkal rendelkezik. |
| Közös alapok | |
| A miniműholdak gazdagok G és C bázisokban. | A mikroszatellitek gazdagok A és T bázisokban. |
| Más nevek | |
| A miniműholdakat változó számú tandem ismétlésnek (VNTR) is ismerik. | A mikroszatelliteket rövid sorozat ismétlődésként (SSR) vagy egyszerű tandem ismétlésként (STR) is ismerik. |
Összefoglaló – Miniműhold vs mikroműhold
A miniszatellit és a mikroműhold a tandem ismétlődések két típusa. Megkülönböztetésük az ismétlődő szekvenciában lévő bázisok száma vagy a szekvencia mérete alapján történik. A miniszatellit 10-100 bázispár hosszúságú ismétlődő szekvenciával, míg a mikroműhold 1-9 bázispár hosszúságú ismétlődő szekvenciával rendelkezik. Ez a fő különbség a miniműhold és a mikroműhold között. Az ismétlődő szekvenciák kópiaszáma a mini- és mikroműholdakban az egyének között igen eltérő. Mind a mini-, mind a mikroszatellitek erőteljes DNS-markerek a fajok populációin belüli és közötti genetikai variációk elemzéséhez.
Minisatellite vs Microsatellite PDF verziójának letöltése
Letöltheti ennek a cikknek a PDF-verzióját, és offline célokra használhatja az idézet megjegyzései szerint. Kérjük, töltse le a PDF verziót innen: Különbség a miniműhold és a mikroműhold között.
