A fő különbség az összekötő és az adapter között, hogy az összekötőnek nincs összefüggő vége, míg az adapternek egy összefüggő vége van.
A DNS-ligálás két DNS-molekula összekapcsolásának folyamata, és foszfodiészter kötések jönnek létre. A DNS-ligáz nevű enzim katalizálja ezt a reakciót. Ez az egyik kritikus lépés a modern molekuláris biológiai területeken, mint például a rekombináns DNS technológia és a DNS klónozás. A ligálás hatékonysága a ligálni kívánt DNS-molekulák végeitől függ. Kétféle DNS-vég létezik: ragadós és tompa vég. A kötés hatékonysága magasabb a ragadós végeknél, mint a tompa végeknél. Ha a cél-DNS-molekulák végük tompa, az adaptereknek vagy linkereknek nevezett molekulák hasznosak lehetnek. Az adapterek és linkerek kémiailag szintetizált oligonukleotid molekulák, amelyek segítenek a DNS-ligálásban. Belső restrikciós oldalaik is vannak. Az adapternek egy ragadós és egy tompa vége van, míg a linkernek két tompa vége van.
Mi az a linker?
A Linker egy kémiailag szintetizált oligonukleotid szekvencia, amely kétszálú. A linkernek két tompa vége van. A linkert olyan DNS-molekulák ligálására használják, amelyeknek tompa vége van a vektorokhoz. Egy vagy több belső korlátozási helyet tartalmaz. Ezek a restrikciós helyek a restrikciós enzimek felismerési helyeiként működnek.
01. ábra: Linker
A ligálás után a DNS-t restrikciós enzimekkel restrikciós enzimekkel újra restrigálják, hogy összefüggő végeket kapjanak. Az EcoRI-linkerek és a sal-I linkerek általában használt linkerek.
Mi az az adapter?
Az adapter egy kétszálú oligonukleotid szekvencia, amelyet két DNS-molekula összekapcsolására használnak. Ez egy rövid sorozat, amelynek egy tompa vége és egy ragadós vagy összefüggő vége van. Ezért az egyik végén egyszálú farok található, ami fokozza a DNS-ligálás hatékonyságát.
02. ábra: DNS-ligálás adapterrel
Sőt, az adapter belső korlátozási helyekkel is rendelkezik. Ezért a ligálás után a DNS-t megfelelő restrikciós enzimekkel lehet restrikciózni, hogy új kiálló terminust hozzunk létre. Az adapterek egyik hátránya, hogy két adapter önmagával párosítva dimmereket tud alkotni. Ez elkerülhető, ha az alkalikus foszfatáz nevű enzimmel kezeljük őket.
Mi a hasonlóság a Linker és az Adaptor között?
- Mind a linker, mind az adapter kétszálú rövid oligonukleotid szekvenciák.
- Belső korlátozási oldalakat hordoznak.
- Sőt, ezek kémiailag szintetizált DNS-molekulák és szintetikus molekulák.
- Két DNS-molekulát tudnak összekapcsolni.
- A linkerek és adapterek ligálása után a DNS-t ismét restrikciós enzimekkel korlátozzák, hogy ragadós végeket hozzon létre.
Mi a különbség a Linker és az Adaptor között?
A linker egy kémiailag szintetizált rövid oligonukleotid duplex, két tompa véggel. Az adapter egy kémiailag szintetizált rövid oligonukleotid duplex, amelynek egyik ragadós és egy tompa vége van. Így ez a legfontosabb különbség a linker és az adapter között. Ezenkívül az adapterek dimereket képezhetnek, míg a linkerek nem alkotnak dimereket. Tehát ez egy másik jelentős különbség a linker és az adapter között.
Az alábbiakban táblázatos formában összefoglaljuk a linker és az adapter közötti különbségeket.
Összefoglaló – Linker vs Adaptor
A linker és az adapter kétféle kémiailag szintetizált oligonukleotid, amelyek hasznosak a tompa végű DNS ligálására. A linkernek két tompa vége van, míg az adapternek egy tompa és egy összefüggő vége van. Tehát ez a legfontosabb különbség a linker és az adapter között. Ezek kétszálú molekulák, amelyek belső restrikciós helyekkel rendelkeznek. Széles körben használják a rekombináns DNS-technológiában és a DNS-klónozásban.
