A legfontosabb különbség a homológia és a hasonlóság között a bioinformatikában az, hogy a homológia két szekvencia közös evolúciós felmenőire vonatkozó kijelentésre utal, míg a hasonlóság két szekvencia közötti hasonlóság mértékére utal.
A bioinformatika olyan tudományterület, amely a biológiát, az informatikát, az informatikát, a matematikát és a statisztikát egyesíti a biológiai adatok elemzésére és értelmezésére. A homológia és a hasonlóság két olyan kifejezés, amelyet a bioinformatika területén használunk. Könnyen kiszámíthatjuk a hasonlóságot a hasonló maradékok százalékában az igazítás adott hosszában. A homológiát azonban nem tudjuk kiszámítani, mivel lehet igaz vagy hamis, és általában az alkalmazott hipotézistől függ.
Mi a homológia a bioinformatikában?
A bioinformatikában a homológia a DNS, az RNS és a fehérjeszekvenciák közötti biológiai homológiára utal, amelyeket az élet evolúciós fájának közös ősi tulajdonságai alapján határoznak meg. Más szavakkal, ez két szekvencia közös evolúciós őse. Az ilyen előfordulás oka lehet speciációs események (ortológok), horizontális génátviteli események (xenológok) vagy duplikációs események (paralógok).
01. ábra: Többszekvenciás igazítás
A DNS, RNS vagy fehérjék közötti homológiát aminosav- vagy nukleotidszekvencia hasonlóságuk alapján lehet következtetni. A jelentős hasonlóság erős bizonyítékként szolgál arra a következtetésre, hogy két szekvencia egy közös ősi szekvenciához kapcsolódik evolúciós változásokkal. A több szekvencia egymáshoz igazítása jelzi az egyes szekvenciák homológ természetű régióit.
Mi a hasonlóság a bioinformatikában?
A bioinformatikában a hasonlóság két fehérje vagy nukleotid szekvencia közötti hasonlóságot méri fel. Ennek a folyamatnak két fő lépése van. A kezdeti lépés a páronkénti igazítás, amely segít megtalálni az optimális igazítást két szekvencia között (beleértve a hézagokat is) olyan algoritmusok segítségével, mint a BLAST, a FastA és a LALIGN. A páronkénti illesztést követően minden páronkénti összehasonlításból két mennyiségi paramétert kell nyerni. Ezek az azonosság és a hasonlóság. A BLAST-ban a keresési hasonlóságokat pozitívnak nevezzük.
02. ábra: Páronkénti igazítás
A konzervatív mutáció akkor következik be, amikor egy aminosav hasonló aminosavvá mutálódik, miközben megőrzi fizikai-kémiai tulajdonságait. Például, ha az arginin +1 pozitív töltésű lizinné mutálódik, ez elfogadott, mivel a két aminosav hasonló tulajdonságokkal rendelkezik, és nem változtatja meg a transzlált fehérjét. Ezért a hasonlóság mérése a két aminosav egymáshoz való viszonyának kritériumaitól függ.
Mi a hasonlóság a homológia és a hasonlóság között a bioinformatikában?
- A homológia és a hasonlóság két szakkifejezés, amellyel a bioinformatikában találkozunk.
- Sőt, mindkét kifejezés a szekvenciák molekuláris elemzésére vonatkozik.
Mi a különbség a homológia és a hasonlóság között a bioinformatikában?
A homológia két szekvencia közös evolúciós felmenőire vonatkozó kijelentésre utal, míg a hasonlóság a két szekvencia közötti hasonlóság mértékére utal. Tehát ez a legfontosabb különbség a homológia és a hasonlóság között a bioinformatikában. Ezenkívül a homológia nem számítható ki, mivel lehet igaz vagy hamis, és általában a hipotézistől függ, míg a hasonlóság könnyen kiszámítható a hasonló csoportok százalékában az igazítás adott hosszában. Ezért ez jelentős különbség a homológia és a hasonlóság között a bioinformatikában.
A következő infografika a homológia és a hasonlóság közötti különbséget sorolja fel a bioinformatikában.
Összefoglaló – Homológia vs hasonlóság a bioinformatikában
Röviden: a homológia és a bioinformatika hasonlósága közötti fő különbség a definíciókban rejlik. A homológia két szekvencia közös evolúciós felmenőinek kijelentése, míg a hasonlóság két szekvencia hasonlósága. A homológia ortológok, paralógok és xenológok miatt fordul elő. A hasonlóság levezetéséhez olyan algoritmusok használhatók, mint a FastA, BLAST és LALIGN. A homológia nem fejezhető ki számításként, de a hasonlóság kifejezhető a hasonló maradékok százalékában az igazítás adott hosszában. Ez tehát a homológia és a hasonlóság közötti különbség összefoglalása a bioinformatikában.
