A legfontosabb különbség a dATP és a ddATP között az, hogy a dATP nem állítja le a DNS-szintézist, míg a ddATP képes leállítani a DNS-szintézist. Ennek az az oka, hogy a ddATP a pentózcukor 3'-helyzetéhez kapcsolódik egy H-atom, míg a dATP-hez egy OH-csoport kapcsolódik a 3'-helyzethez.
A dNTP-k a DNS építőkövei. A dNTP-nek négy típusa van a purin- vagy pirimidinbázis szerint – ezek közül az egyik a dATP. A dATP nitrogéntartalmú bázisa az adenozin. A ddNTP-k a Sanger-szekvenálásban használt nukleotidok. A ddNTP-knek négy típusa van. A ddATP egy ddNTP.
Mi az a dATP?
A dezoxiadenozin-trifoszfát egy nukleotid, amely a DNS építőköve. A DNS-polimeráz enzim a dATP-t használja szubsztrátként a DNS-szintézishez. A dATP három összetevőből áll: egy dezoxiribóz cukormolekulából, egy adenozinból és a három foszfátcsoportból. Ezért ez egy purin-nukleozid-trifoszfát. A dATP kémiai képlete: C10H16N5O12 P3, és molekulatömege 491,182.
01. ábra: dATP
dATP a cukorkomponensek tekintetében különbözik az ATP-től (adenozin-trifoszfát). Az ATP ribóz cukrot tartalmaz. dATP bázispárok uracil nukleotiddal a transzkripció során. Amellett, hogy részt vesz a DNS-szintézisben, a dATP energiatranszfer molekulaként is működhet a sejtek életképességének fenntartása érdekében. A dATP magas szintje a szervezetben mérgező, mivel a ribonukleotid-reduktáz enzim nem kompetitív inhibitoraként működhet. Ez az immunrendszer károsodásához vezethet.
Mi az a ddATP?
A didezoxiadenozin-trifoafát vagy ddATP egyike a Sanger-féle szekvenálási módszerben használt négy nukleotidtípusnak. Szerkezetileg a ddATP-nek három, a dATP-hez hasonló összetevője is van. Ezek egy adenin bázis, egy dezoxiribóz cukor és három foszfát.
02. ábra: ddATP
A dATP-vel ellentétben a ddATP-ben hiányzik az OH-csoport a pentózcukor 3'-helyzetében, hogy foszfodiészter kötést hozzon létre a szomszédos nukleotiddal, és folytassa a lánc megnyúlását. H atomja van a 3' pozícióban. Ezért a ddATP beépülése után a DNS-szintézis véget ér. Ez a Sanger szekvenálás alapelve. Ezért a ddATP láncmegnyúlás-gátlóként működik a Sanger-szekvenálásban. A Sanger-szekvenáláshoz négy csövet használnak, és egy csőhöz ddATP-t adnak.
Mi a hasonlóság a dATP és a ddATP között?
- dATP és ddATP nukleotidok.
- Mindkettő adeninből, dezoxiribózból és három foszfátból áll.
- Ezek szerves vegyületek.
- Mind a dATP, mind a ddATP hozzáadásra kerül a csövekbe a Sanger-szekvenálás során.
Mi a különbség a dATP és a ddATP között?
A dATP OH-csoportot tartalmaz a pentózcukor 3'-helyzetében, míg a ddATP-ben hiányzik az OH-csoport a pentózcukor 3'-helyzetében. Ezenkívül a dATP a DNS-szintézisben használt monomer, míg a ddATP-t a lánc megnyúlásának leállítására használják a Sanger-szekvenálás során. Tehát ez a legfontosabb különbség a dATP és a ddATP között. Ezenkívül a dATP foszfodiészter kötéseket tud kialakítani, míg a ddATP nem tud foszfodiészter kötéseket.
Az alábbi infografika több különbséget mutat be a dATP és a ddATP között táblázatos formában az egymás melletti összehasonlításhoz.
Összefoglaló – dATP vs ddATP
Röviden, a dATP a DNS-szintézis előfutára, míg a ddATP a DNS-szintézis leállítására használt nukleotid a Sanger-szekvenálás során. Ezenkívül a dATP OH-csoportot tartalmaz a pentózcukor 3'-helyzetében, és lehetővé teszi egy foszfodiészter kötés kialakulását a következő nukleotiddal. Eközben a ddATP-ből hiányzik az OH-csoport a 3'-helyzetben; ezért nem képes foszfodiészter kötést kialakítani a következő nukleotiddal. Ennek eredményeként a DNS-szekvencia megszakítja a megnyúlását. Így ez összefoglalja a dATP és a ddATP közötti különbséget.
