Fő különbség – bakteriális transzpozázok vs retrovírus integrázok
A szállítható genetikai anyag két fő stratégiával fejlődött ki, hogy az egyik régióból a következő régióba kerüljön a genomokon belül és közöttük. Az egyik módszer az RNS-molekulán keresztül történő kiszorítása a DNS-molekula kialakulása előtt, míg a másik út DNS-intermediereket foglal magában. A transzpozázok és a vírusintegrázok példák az ilyen transzponálható genetikai anyagokra. A bakteriális transzpozázok a transzpozonok végéhez kötődnek, és különféle mechanizmusokon keresztül megkönnyítik a transzpozon mozgásának katalízisét a genom egy másik részébe. A retrovírus integrázok olyan enzimek, amelyek elősegítik a retrovírus, például a HIV genetikai anyagának az általa megfertőzött gazdasejt genetikai anyagába (DNS) történő integrálását. Ez a legfontosabb különbség a bakteriális transzpozázok és a retrovírus integrázok között.
Mik azok a bakteriális transzpozázok?
A transzpozáz a transzpozonok végéhez kötött enzimként definiálható, amely különféle mechanizmusokon keresztül elősegíti a transzpozon mozgásának katalizálását a genom egy másik részébe. Ilyen mechanizmusok közé tartozik a „kivágás és beillesztés” és a „replikatív átültetési mechanizmus”. A transzpozázt először a Tn3 transzpozon transzpozíciójához szükséges enzim klónozásával vezették be. A transzponálható genetikai elemek két fontos stratégiát alkalmaztak a genomok közötti vagy az egyik helyről a másikra való áthelyezésre. Az egyik stratégia az RNS intermedieren keresztül történő szállítása a DNS-másolat szintézise előtt, míg a másik a DNS intermedierekhez való kötődése. A rekombinációs reakciók, amelyek mindkét elem integrációjában szerepet játszanak, az elemspecifikus enzimek hatására mennek végbe. Így DNS-elemek esetében ezeket az enzimeket transzpozázoknak, míg RNS-elemeknél integrázoknak nevezik.
A két transzpozíciós stratégia közötti különbségek összehasonlításakor a beillesztés folyamata kémiailag azonosnak tűnik. A legújabb bizonyítékok azonban azt sugallják, hogy az integrációs mechanizmus bizonyos hasonlóságai az aminosavszekvenciák azon régióiban láthatók, amelyek aktív helyet képeznek; a DDE motívum. Jelenleg öt transzpozázcsalád osztályozása zajlik, de a családok száma még nem növekszik új transzpozáz karakterekkel. A családok közé tartozik a DDE transzpozáz, tirozin (Y) transzpozáz, szerin (S) transzpozáz, gördülő kör transzpozáz, reverz transzkriptáz/endonukleáz (RT/En) stb. Ezek a családok egyedi katalitikus mechanizmusokat alkalmaznak a DNS feltörésére és újracsatlakoztatására. A DDE transzpozáz részt vesz az eredeti transzpozon kivágás és beillesztés mechanizmusában, és három konzervált aminosav-készletet hordoz, nevezetesen; aszpartát (D), aszpartát (D) és glutamát (E). A tirozin transzpozázok részt vesznek a kivágás és beillesztés mechanizmusában is a tirozin maradék felhasználásával, ami helyspecifikus.
01. ábra: Bakteriális transzpozázok
A szerin transzpozázok egy cirkuláris DNS intermedierjét foglalják magukban, és a kivágás és beillesztés mechanizmusát ugyanúgy hajtják végre, mint a családoknál. A gördülő kör transzpozáz részt vesz a másolási mechanizmusban, ahol egyetlen szál közvetlenül másolódik a célhelyre a DNS-replikáció révén. Ez biztosítja, hogy a templátszál és a másolt szál egy újonnan szintetizált szálat tartalmazzon. A reverz transzkriptázok/endonukleázok transzpozáz különböző mechanizmusokkal rendelkezik a transzpozícióhoz.
Mik azok a retrovírus integrázok?
A Retroviral Integrase összefüggésében retrovírus enzimnek tekintik, amely elősegíti a retrovírus, például a HIV genetikai anyagának a fertőzött sejt genetikai anyagába (DNS) történő integrálását. Ezeket a retrovírus-integrázokat leggyakrabban összekeverik a fágintegrázokkal. A fágintegrázok példái a λ fágintegráz. De ezek teljesen más enzimek, és nem szabad összetéveszteni velük. A retrovirális preintegrációs komplex kialakításában a retrovirális integráz játszik nagy szerepet. A retrovírus integráz fehérjék jellemzően három (03) kanonikus doménből állnak. Ezeket a tartományokat rugalmas linkerek kötik össze.
A három domén egy N-terminális cinkkötő domént tartalmaz, ahol három spirális köteg kapcsolódik és koordináció révén stabilizálódik egy Zn2+ kation, egy RNáz H-redő bevonásával. katalitikus magdomén és egy C-terminális DNS-kötő domén, amely egy SH3-redő. Vizsgálatok, valamint biokémiai és szerkezeti információk alapján azt sugallják, hogy a retrovírus integráz képes dimer dimerként (tetramerként) működni. A multimerizáció és a virális DNS-kötés összefüggésében a retrovirális integráz fehérje mindhárom doménje. A retrovirális integráz fő funkciója, hogy genetikai anyagát beépítse a gazda DNS-ébe. Ez a lépés a HIV-vírus vírusreplikációjának legdöntőbb lépése. Sikeres integráció után élete hátralévő részében ott lesz a sejt kromoszómális DNS-ében.
02. ábra: Retrovirális integrázok
Ezért az integrálást követően nincs visszaút a cellának. Ezek a retrovírus-integrázok két fő reakció katalizálásában vesznek részt, beleértve a 3'-végi feldolgozást és a kovalens ligálást. A 3'-végi feldolgozás során a vírus DNS mindkét 3'-végéről 2-3 nukleotidot távolítanak el azzal a szándékkal, hogy feltárják a vírus DNS 3'-végeinek CA-dinukleotidjait, a kovalens ligálás során pedig a vírus DNS feldolgozott 3'-végét. a vírus DNS kovalensen ligálódik a gazda kromoszómális DNS-ébe.
Mi a hasonlóság a bakteriális transzpozázok és a retrovírus integrázok között?
Mind a bakteriális transzpozázok, mind a retrovírus integrázok hasonló aminosavszekvenciákkal rendelkeznek
Mi a különbség a bakteriális transzpozázok és a retrovírus integrázok között?
Bakteriális transzpozázok vs retrovírus integrázok |
|
| A bakteriális transzpozáz egy olyan enzim, amely a transzpozonok végéhez kötődik, miközben elősegíti a transzpozon mozgásának katalízisét a genom egy másik részébe különböző mechanizmusokon keresztül. | A A Retroviral Integrases retrovírus enzimnek tekinthető, amely elősegíti a retrovírus, például a HIV genetikai anyagának a fertőzött sejt genetikai anyagába (DNS) történő integrálását. |
| Kötési régiók | |
| Magas specifikus kötő régiókra van szükség a bakteriális transzpozázokhoz. | Kevesebb vagy egyáltalán nem szükséges nukleotidszekvencia a kötéshez. |
Összefoglaló – Bakteriális transzpozázok vs retrovírus integrázok
A bakteriális transzpozázokat retrovírus enzimnek tekintik, amely elősegíti a retrovírus, például a HIV genetikai anyagának a fertőzött sejt genetikai anyagába (DNS) történő integrálását. A transzponálható genetikai elemek két fontos stratégiát alkalmaztak a genomok közötti vagy az egyik helyről a másikra való áthelyezésre. Jelenleg öt transzpozázcsalád osztályozása zajlik, de a családok száma még nem növekszik új transzpozáz karakterekkel. Retrovirális integráz, retrovírus enzimnek tekintik, amely elősegíti a retrovírus, például a HIV genetikai anyagának a fertőzött sejt genetikai anyagába (DNS) történő integrációját. A retrovírus integráz fehérjék jellemzően három (03) kanonikus doménből állnak. A retrovirális integráz fő funkciója, hogy genetikai anyagát beépítse a gazda DNS-ébe. Ez a lépés a HIV-vírus vírusreplikációjának legdöntőbb lépése. Ezért az integráció után a cellának nincs visszaútja. Ez a különbség a bakteriális transzpozázok és a retrovírus integráz között.
A bakteriális transzpozázok és retrovírus integrázok PDF letöltése
A cikk PDF-verzióját letöltheti, és offline célokra használhatja az idézési megjegyzés szerint. Kérjük, töltse le a PDF verziót innen: Különbség a bakteriális transzpozázok és a retrovírus integrázok között
