A legfontosabb különbség az RNS polimeráz mag és a holoenzim között az, hogy az RNS polimeráz mag egy olyan enzim, amely nem tartalmaz szigma faktort, míg az RNS polimeráz holoenzim egy szigma faktorból álló enzim.
A baktériumokban történő transzkripció egy olyan folyamat, amelyben a bakteriális DNS egy szegmensét egy RNS polimeráz enzim segítségével egy újonnan szintetizált mRNS-szálba másolják. Ez a folyamat három fő lépésből áll: iniciáció, megnyúlás és befejezés. A bakteriális RNS polimeráz 6 alegységből áll. Az RNS polimeráz magja β, β′, α2 és ω alegységekből áll. Ez az RNS-polimeráz mag holoenzimmé alakul át, amikor σ (szigma) faktor kötődik a magenzimhez. Az RNS polimeráz mag és a holoenzim a bakteriális RNS polimeráz enzim két formája.
Mi az az RNS-polimeráz mag?
RNS polimeráz mag a bakteriális transzkripcióban részt vevő enzim, amely mentes a szigma faktortól. 5 alegységből áll, amelyeket β, β′, α2 és ω jelekkel jelöltek. Ez az enzim nem indít specifikus transzkripciót bakteriális és fág DNS-promoterekből. Ennek az az oka, hogy nem ismer fel semmilyen specifikus bakteriális vagy fág DNS-promotert. Ez az enzim azonban megőrzi azt a képességét, hogy RNS-t írjon át a nem specifikus iniciációs szekvenciákból. Ezenkívül a szigma faktor hozzáadása ehhez az enzimhez lehetővé teszi az enzim számára, hogy RNS szintézist indítson el specifikus bakteriális és fág promóterekből. Az RNS polimeráz magenzim molekulatömege körülbelül 400 kDa.
01. ábra: RNS-polimeráz mag
A magenzim az RNS-polimeráz katalitikus tulajdonságait tartalmazza. Az α alegység egy homodimer, amelynek mérete 36,5 kDa. Az rpoA gén kódolja. Ennek az alegységnek a funkciói az RNAP összeállítása, a DNS-sel való kölcsönhatások és a transzkripciós szabályozáshoz szükséges transzkripciós faktorok. A Β alegység mérete 150,4 kDa. Az rpoB gén kódolja. Ennek az alegységnek a funkciói a DNS- és RNS-kötés, az RNS-szintézis, az NTP-kötés, az RMP-kötőhely és a σ-faktor-kötés. A β′ alegység mérete 155 kDa, és az rpoC gén kódolja. Ennek az alegységnek a funkciói a DNS-kötés, az RNS-szintézis, a katalitikus Mg2+ koordináció, az 1. ppGpp kötőhely és a σ faktor kötődés. Ezenkívül az ω faktor mérete 10,2 kDa, és az rpoZ gén kódolja. Az ω faktor funkciója az RNAP folding és a ppGpp kötőhely 1.
Mi az RNS-polimeráz holoenzim?
Az RNS polimeráz holoenzim a β, β′, α2 és ω alegységektől eltérő szigmafaktorként ismert specifikus komponensből áll. A szigma faktor miatt az RNS polimeráz holoenzim képes felismerni a promotereket. A szigma faktor segíti az RNS polimeráz holoenzim helyes elhelyezését és a kiindulási helyen történő letekeredést is. Amint a szigma faktor betölti a szükséges és specifikus funkciót, disszociál az RNS polimeráz holoenzimről, miközben az RNS polimeráz katalitikus része (β, β′, α2 és ω) a DNS-ben marad, és folytatja a transzkripciót.
02. ábra: RNS-polimeráz holoenzim
A szigma faktorok száma baktériumfajonként változik. Az E. coli hét szigmafaktorral rendelkezik. Ezenkívül a szigma faktorokat jellemző molekulatömegük is megkülönbözteti. Például a σ70 a 70 kDa molekulatömegű szigma faktor. A baktériumok különböző környezeti feltételek mellett különböző szigma faktorokat használnak fel. Példák a különböző σ tényezőkre: σ19, σ24, σ18, σ32, σ38 és σ54
Mi a hasonlóság az RNS-polimeráz mag és a holoenzim között?
- RNS polimeráz mag és holoenzim a bakteriális RNS polimeráz enzim két formája.
- Mindkét forma részt vesz a bakteriális transzkripcióban.
- Van alegységeik.
- Ezek aminosavakból álló fehérjemolekulák.
Mi a különbség az RNS-polimeráz mag és a holoenzim között?
Az RNS polimeráz mag egy olyan enzim, amely nem tartalmaz szigmafaktort, míg az RNS polimeráz holoenzim egy szigmafaktorból álló enzim. Így ez a legfontosabb különbség az RNS polimeráz mag és a holoenzim között. Továbbá az RNS polimeráz mag főként a transzkripció elongációs lépésében vesz részt, míg az RNS polimeráz holoenzim főként a transzkripció iniciációs lépésében katalizál.
Az alábbi infografika az RNS polimeráz mag és a holoenzim közötti különbségeket mutatja be táblázatos formában, egymás melletti összehasonlítás céljából.
Összefoglaló – RNS-polimeráz mag vs holoenzim
A bakteriális RNS polimeráz egy több alegységből álló DNS-függő enzim. Részt vesz a baktériumok transzkripciójában. Ez a génexpresszió kulcsenzime és a szabályozás célpontja. Az RNS polimeráz mag és a holoenzim a bakteriális RNS polimeráz enzim két formája. Az RNS polimeráz mag nem rendelkezik szigma faktorral, míg az RNS polimeráz holoenzim egy szigma faktorból áll. Tehát ez összefoglalja az RNS polimeráz mag és a holoenzim közötti különbséget.
