A legfontosabb különbség a sejtmentes DNS és a keringő tumor DNS között az, hogy a sejtmentes DNS a DNS különböző formái, amelyek szabadon keringenek a vérben, míg a keringő tumor DNS a fragmentált, daganatból származó DNS, amely a vérben kering.
A sejtmentes DNS és a keringő tumor DNS kétféle keringő nukleinsav. A keringő nukleinsavakat Mandel és Metal fedezte fel 1948-ban. Később kiderült, hogy a keringő nukleinsavak mennyisége a beteg betegekben jelentősen magas. Ezt a felfedezést először lupus betegekkel kapcsolatban tették. Ezenkívül a keringő nukleinsavak magasabb prognosztikai értékkel rendelkeznek, és biomarkerként használhatók különféle betegségek kimutatására.
Mi az a sejtmentes DNS?
Sejtmentes DNS (Cf DNS) a DNS különféle formáira utal, mint például a keringő tumor DNS, sejtmentes mitokondriális DNS és sejtmentes magzati DNS stb., amelyek szabadon keringenek a vérben. A sejtmentes DNS megemelkedett szintjét olyan előrehaladott betegségekben figyelik meg, mint a rák, trauma, szepszis, szívinfarktus, cukorbetegség, szélütés, sarlósejtes betegség stb. A rák és a magzatgyógyászat mellett a sejtmentes DNS hasznos biomarker betegségek sokasága. Ez a DNS felhasználható a transzplantátum kilökődésének kimutatására is. Használják a hétköznapi stressz, a születés előtti nemi megkülönböztetés és az apasági vizsgálat során is.
01. ábra: Sejtmentes DNS
A sejtmentes DNS általában egy kettős szálú extracelluláris DNS-molekula. Kis fragmentumokból (50-200 bp) és nagyobb fragmentumokból (21 kb) áll. Ezenkívül már elismerték, hogy megbízható biomarker a prosztata- és mellrák diagnosztizálásában. A sejtmentes DNS túlnyomórészt nukleoszómaként kering a véráramban. A nukleoszómák hisztonok és DNS nukleáris komplexei. A cf DNS mennyiségi meghatározása különféle technikákkal, például PCR, masszívan párhuzamos szekvenálás, ultraibolya spektrometria, PicoGreen festés és ELISA segítségével határozható meg. Mivel a Cf DNS kimutatása a véráramban egy gyors, egyszerű, nem invazív, ismétlődő módszer, a jövőben potenciális biomarker lesz számos betegség, például autoimmun reumás betegségek és daganatok diagnosztizálásában.
Mi az a keringő tumor DNS?
A keringő tumor DNS (Ct DNS) a vérben keringő, fragmentált, daganatból származó DNS. Daganatos eredetű. Mivel a keringő daganat tükrözheti a teljes tumorgenomot, széles körben vonzotta a klinikai elrendezésekben való potenciális alkalmazhatóságát. Folyékony biopsziák, amelyek vért vesznek, felhasználhatók a keringő daganatok vizsgálatára.
02. ábra: Keringő tumor DNS
A Ct DNS felszabadításában valószínűleg szerepet játszó biológiai folyamatok közé tartozik az apoptózis és a nekrózis az elhaló sejtekből vagy az aktív felszabadulás a tumorsejtekből. Az egészséges szövetekben az infiltráló fagociták képesek kitisztítani a Ct DNS-t. Ezenkívül különféle technikák használhatók a keringő tumor-DNS elemzésére, például csepp digitális PCR, BEAMing, CAPP-Seq (mély szekvenálás), biztonságos szekvenálás és duplex szekvenálás.
Mi a hasonlóság a sejtmentes DNS és a keringő tumor DNS között?
- A sejtmentes DNS és a keringő tumor DNS kétféle keringő nukleinsav.
- Nukleotidokból állnak.
- Mindkét típus potenciális markerként használható különböző betegségek diagnosztizálására a klinikai elrendezésben.
- A véráramban találhatók.
- Mindkettő a DNS-molekulák sejten kívüli formája.
- Mindkettőt kitisztítják a beszivárgó fagociták.
Mi a különbség a sejtmentes DNS és a keringő tumor DNS között?
A sejtmentes DNS a DNS különböző formái, mint például a keringő tumor DNS, a sejtmentes mitokondriális DNS és a sejtmentes magzati DNS stb., amelyek szabadon keringenek a vérben, míg a keringő tumor DNS a fragmentált tumor eredetű DNS. amely a vérben kering. Tehát ez a legfontosabb különbség a sejtmentes DNS és a keringő tumor DNS között. Ezenkívül a sejtmentes DNS 50-220 bp méretű fragmentumokban kering, míg a keringő tumor DNS 134-144 bp méretű fragmentumokban kering.
A következő infografika a sejtmentes DNS és a keringő tumor DNS közötti különbséget mutatja be táblázatos formában, egymás melletti összehasonlításhoz.
Összefoglaló – Sejtmentes DNS kontra keringő tumor DNS
A keringő nukleinsavak szabályozott vagy véletlenszerű mechanizmusokon keresztül kerülnek a véráramba. A sejtmentes DNS és a keringő tumor DNS kétféle keringő nukleinsav. A sejtmentes DNS a DNS különféle formái, például keringő tumor DNS, sejtmentes mitokondriális DNS, sejtmentes magzati DNS, amelyek szabadon keringenek a vérben, míg a keringő tumor DNS a fragmentált tumorból származó DNS, amely a vérben kering. Így ez összefoglalja a különbséget a sejtmentes DNS és a keringő tumor DNS között.