A legfontosabb különbség a T4 DNS-ligáz és az E. coli DNS-ligáz között az, hogy a T4 DNS-ligáz egy olyan enzim, amelyet a T4 bakteriofágból izolálnak, míg az E. coli DNS-ligáz egy olyan enzim, amelyet az E. coli baktériumból izolálnak..
A DNS-ligáz egy specifikus típusú enzim, amely elősegíti a DNS-szálak összekapcsolását egy foszfodiészter-kötés kialakításával. Fontos szerepet játszik az élő szervezetek DNS-ében az egyszálú és kétszálú törések kijavításában. Ezenkívül a DNS-ligázt mind a DNS-javításban, mind a DNS-replikációban használják. A fenti felhasználásokon kívül a DNS-ligázt széles körben használják molekuláris biológiai kísérletekben, például a rekombináns DNS-technológiában. A T4 DNS-ligáz és az E. coli DNS-ligáz kétféle DNS-ligáz enzim.
Mi az a T4 DNS-ligáz?
A T4 ligáz egy DNS-csatlakozó enzim, amelyet a T4 bakteriofágból izolálnak. A T4 bakteriofág egy vírus, amely megfertőzi az Escherichia colit. A T4 ligáz enzim a molekuláris biológiai laboratóriumi kutatásokban leggyakrabban használt DNS-ligáz. Normális esetben a T4 ligáz katalizálja a kettős szálú DNS két összefüggő vagy tompa végű szálának összekapcsolását a szomszédos nukleotidok 5' foszfát és 3' hidroxil csoportja között. Azt is katalizálhatja, hogy az RNS kapcsolódjon egy DNS- vagy RNS-szálhoz egy duplex molekulában. Ez az enzim azonban nem csatlakozik egyszálú nukleinsavakhoz. Ezen túlmenően a tompa végű DNS-t is sokkal nagyobb hatékonysággal képes ligálni, mint az E. coli DNS-ligáz.
01. ábra: T4 DNS-ligáz
Ennek az enzimnek kofaktorként ATP-re van szüksége. Egyes géntechnológiai kutatási kísérletek már több aktív DNS-ligáz enzimet termeltek, mint a vad típusú T4 DNS-ligáz. Az egyik megközelítésben fúziós enzimmolekulát hoztak létre úgy, hogy a T4 DNS-ligázt p50 vagy NF-kB molekulával kombinálták. Ez az új T4 ligáz enzim 160%-kal aktívabb volt a tompa végű klónozási célú ligálások során, mint a vad típusú T4 DNS ligáz. Ezenkívül a T4 DNS-ligáz optimális hőmérséklete a ligációs reakció pontosabb katalizálásához 16 °C.
Mi az az E Coli DNS-ligáz?
E. coli DNS-ligáz egy enzim, amelyet E. coli baktériumokból izolálnak. Az E. coli DNS-ligáz előállításáért felelős gén a lig gén. Az E. coli DNS, a ligáz, valamint a legtöbb prokarióta DNS ligáz a NAD (nikotinamid-adenin-dinukleotid) által nyert energiát használja fel a foszfodiészter kötés létrehozására.
02. ábra: E. Coli DNS ligáz
E. coli DNS-ligáz egy ligáló enzim, amely képes összekapcsolni a DNS-fragmenseket azáltal, hogy katalizálja a foszfodiészter kötések kialakulását az 5'-foszfát- és 3'-hidroxil-végeket tartalmazó kettős szálú DNS-fragmensek között. Ezenkívül nem köti össze a tompa végű DNS-t, kivéve különleges körülmények között, például molekuláris zsúfoltság esetén polietilénglikollal. Nem tud hatékonyan összekapcsolni az RNS-t a DNS-sel. Továbbá az E. coli DNS-ligáz aktivitása fokozható a DNS-polimeráz 1 megfelelő koncentrációjú jelenlétével. Ha azonban a DNS polimeráz 1 enzim koncentrációja magasabb, az káros hatással van az E. coli DNS ligáz aktivitására.
Mi a hasonlóság a T4 DNS-ligáz és az E Coli DNS-ligáz között?
- A T4 DNS-ligáz és az E-coli DNS-ligáz kétféle DNS-ligáz enzim.
- Mindkettő aminosavakból álló fehérje.
- Ezek az enzimek katalizálják a foszfodiészter kötés kialakulását a duplex DNS-ben egymás mellé helyezett 5'-foszfát- és 3'-hidroxil-végek között.
- Kiterjedten alkalmazzák őket molekuláris biológiai kísérletekben, például a rekombináns DNS-technológiában.
Mi a különbség a T4 DNS-ligáz és az E Coli DNS-ligáz között?
A T4 DNS-ligáz egy olyan enzim, amelyet a T4 bakteriofágból, míg az E. coli DNS-ligáz egy olyan enzim, amelyet E. coli baktériumokból izolálnak. Így ez a legfontosabb különbség a T4 DNS-ligáz és az E. coli DNS-ligáz között. Ezenkívül a T4 DNS-ligáz energiaforrása az ATP. Másrészt az E. coli DNS-ligáz energiaforrása a NAD.
Az alábbi infografika a T4 DNS-ligáz és az E. coli DNS-ligáz közötti különbségeket mutatja be táblázatos formában, egymás melletti összehasonlítás céljából.
Összefoglaló – T4 DNS-ligáz vs E Coli DNS-ligáz
A T4 DNS-ligáz és az E. coli DNS-ligáz két olyan enzim, amelyek katalizálják a foszfodiészter-kötés kialakulását a duplex DNS-ben egymás mellé helyezett 5'-foszfát- és 3'-hidroxil-végek között. A T4 ligáz egy olyan enzim, amelyet a T4 bakteriofágból izolálnak, míg az E. coli DNS-ligáz egy olyan enzim, amelyet E. coli baktériumokból izolálnak. Tehát ez a legfontosabb különbség a T4 DNS-ligáz és az E. coli DNS-ligáz között.
