A legfontosabb különbség az izoszkizomerek és a neoszkizomerek között az, hogy az izoszkizomerek olyan restrikciós enzimek, amelyeknek ugyanaz a felismerési szekvenciája, és ugyanazokon a helyeken hasítják a DNS-t, míg a neoschizomerek olyan restrikciós enzimek, amelyek azonos felismerési szekvenciával rendelkeznek, de a DNS-t különböző pozíciókban hasítják..
A restrikciós enzimek vagy restrikciós endonukleázok olyan enzimek, amelyek meghatározott felismerési helyeken vagy azok közelében fragmentumokra hasítják a DNS-t. Elvágják a DNS-t a restrikciós helyeken. A restrikciós enzimeket rendszerint öt csoportba sorolják szerkezetük alapján, hogy a felismerési helyükön elvágják-e DNS-szubsztrátjukat, és hogy a felismerési és hasítási helyek elkülönülnek-e egymástól. Már több mint 3600 restrikciós endonukleázt azonosítottak. Körülbelül 800 restrikciós enzim kapható a kereskedelemben. Az izoszkizomerek és a neoschizomerek kétféle restrikciós enzim a felismerési hely és a hasítási specifitás alapján.
Mik azok az izoschizomerek?
Az izoskizomerek olyan restrikciós enzimek, amelyeknek azonos a felismerési szekvenciája, és ugyanazokon a helyeken hasítják a DNS-t. Ezek a restrikciós enzimek azonos specifitásúak. Az elsőként felfedezett restrikciós enzimet, amely felismer egy adott szekvenciát, prototípusnak nevezik, míg az összes később azonosított restrikciós enzimet, amely felismeri ugyanazt a szekvenciát, izoschizomernek nevezik. Az izoszkizomerek azonban eltérhetnek a helyszín preferenciáitól, a reakciókörülményektől, a metilációs érzékenységtől és a csillagaktivitástól. Az izoschizomereket különböző baktériumtörzsekből izolálják. Ezért eltérő reakciókörülményeket igényelhetnek. Egyes esetekben az izoschizomerek közül csak egy képes felismerni a restrikciós helyek metilezett és nem metilált formáit. Másrészt a másik restrikciós enzim csak a restrikciós hely nem metilált formáját tudja felismerni. Az izoszkizomerek ezen sajátossága segít a restrikciós hely metilációs állapotának azonosításában, miközben elkülöníti azt a bakteriális állapottól.
Például az AgeI és a BshT1 felismeri és hasítja az 5’-A↓CCGGT-t ugyanabban a mintában. A HpaII és az MSPI más izoszkizomerpárok. Mindketten felismerik az 5’-C↓CGG-3’ szekvenciát, ha az metilálatlan. De amikor a szekvencia második C-je metilált, csak az MSPI képes felismerni ezt a szekvenciát, míg a HpaII nem ismeri fel.
Mik azok a neoschizomerek?
A neoschizomerek olyan restrikciós enzimek, amelyek azonos felismerési szekvenciával rendelkeznek, de a DNS-t különböző pozíciókban hasítják. Egyes speciális molekuláris biológiai alkalmazásokban ez nagyon hasznos funkció. A neoschizomerek az izoszkizomerek egy részhalmazát alkotják. A neoschizomerek jól ismert példái a SmaI (5’-CCC↓GGG-3’) és az XmaI (5’-C↓CCGGG-3’); mindkettő felismeri az 5’-CCCGGG-3’ szekvenciát, de más pozícióban hasítja őket. Így ez a két restrikciós enzim különböző típusú végeket hoz létre. Ebben az esetben a SmaI tompa végeket, az XmaI pedig 5’-os kiálló végeket eredményez.
01. ábra: Neoschizomers
Egy másik példa a MaeII és Tail restrikciós enzimek párja. A MaeII prototípus (A↓CGT) 2 bázisból álló 5’-hosszabbítású DNS-fragmenseket, a neoschizomer Tail (ACGT↓) pedig 4-bázisú, 3’-es kiterjesztésű DNS-fragmenseket termel.
Mi a hasonlóság az izoskizomerek és a neoschizomerek között?
- Az izoschizomerek és a neoschizomerek kétféle restrikciós enzim.
- Túlnyomórészt prokariótákban találhatók meg.
- A baktériumokban és archaeákban megtalálható restrikciós-módosító (RM) rendszer részét képezik.
- Mindkettő fehérjemolekula.
- Mindkettő darabokra hasítja a DNS-t.
Mi a különbség az izoschizomerek és a neoschizomerek között?
Az izoszkizomerek olyan restrikciós enzimek, amelyek azonos felismerési szekvenciával rendelkeznek, és ugyanazokon a pozíciókon hasítják a DNS-t, míg a neoschizomerek olyan restrikciós enzimek, amelyek azonos felismerési szekvenciával rendelkeznek, de a DNS-t különböző pozíciókban hasítják. Tehát ez a legfontosabb különbség az izoschizomerek és a neoschizomerek között. Ezenkívül az izoszkizomerek azonos, míg a neoschizomerek eltérő specifitásúak.
A következő infografika táblázatos formában sorolja fel az izoszkizomerek és a neoschizomerek közötti különbségeket egymás melletti összehasonlítás céljából.
Összefoglaló – Isoschizomers vs Neoschizomers
A restrikciós enzimek DNS-vágó enzimek. Molekuláris ollónak is nevezik őket. Különféle restrikciós enzimek léteznek. A felismerési hely és a hasítási specifitás alapján a restrikciós enzimek két típusba sorolhatók: izoschizomerek és neoschizomerek. Az izoszkizomerek azonos felismerési szekvenciával rendelkeznek, és ugyanazokon a pozíciókon hasítják a DNS-t, míg a neoschizomerek azonos felismerési szekvenciával rendelkeznek, de a DNS-t különböző pozíciókban hasítják. Így ez a legfontosabb különbség az izoschizomerek és a neoschizomerek között.
