A szinténia és a kollinearitás közötti kulcsfontosságú különbség az, hogy a szinténia a genetikai lókuszok fizikai együttes lokalizációja ugyanazon a fajon belüli kromoszómán, míg a kollinearitás a genetikai lókuszok fizikai együttes lokalizációja ugyanazon a kromoszómán különböző fajokban. ugyanaz a sorrend.
A szinténia és a kollinearitás két olyan kifejezés, amelyeket felcserélhetően használnak a genomikában. Mindkét kifejezés leírja a gén lokalizációs mintázatait a kromoszómákon különböző fajokban. Ezek a rokon génelrendeződések a taxonok között értékes információk a gének közös származására. A szinténia a genetikai lókuszok fizikai együttes lokalizációját jelenti ugyanazon a kromoszómán a fajokban. A kollinearitás az ugyanazon kromoszómán lévő genetikai lókuszok fizikai együttes lokalizációjára utal különböző fajokban, ugyanazt a sorrendet megőrizve. Ezért ez a szinténia egy formája.
Mi az a Synteny?
A különböző fajokban egy sor gén található ugyanazon a kromoszómán. És a különböző fajokban ugyanazon a kromoszómán lévő gének fizikai együttes lokalizációját szinténiának nevezik. Ezenkívül ezek a gének nagyon közel találhatók egymáshoz egyetlen kromoszómán. A gének sorrendje nem feltétlenül azonos. De a gének egymáshoz közeli lokalizációja ugyanazon a kromoszómán szinténiában történik. Ezért a szinténia főként a gének eloszlási mintázatát írja le egy kromoszómán. Ezek a gén-ko-lokalizációs minták a különböző fajok és evolúciójuk közötti kapcsolatokra utalnak. A szinténia azonban megszakadhat kromoszóma-átrendeződések miatt, mint például transzlokációk, inverzió és kromoszómafúzió stb. duplikációk, elvesztés és egyenlőtlen homológ rekombináció.
01. ábra: Synteny
Úgy tartják, hogy minden kapcsolt gén szintetikus. Azonban nem minden szintetikus gén kapcsolódik szükségszerűen. Közös kromoszómaszekvenciákkal rendelkeznek. Az embernek sok szintetikus génje van más emlősökkel. Sőt, sok gabonafélének szintetikus génjei vannak.
Mi az a kollinearitás?
A kollinearitás a szinténia egy specifikusabb formája, amelyben a gének egy csoportja különböző fajok ugyanazon kromoszómáján helyezkedik el, ugyanabban a sorrendben, mint az ősi fajokban. Ezért, ha eltérés van a kollinearitástól, az megbízhatóbb filogenetikai karakter lesz, mivel a kollinearitás megmagyarázza a gének közös őseit.
02. ábra: Kollinearitás
A többirányú kollinearitáselemzés sokkal megbízhatóbb információt nyújt a rokon fajokról és törzsfejlődésükről.
Mi a hasonlóság a szinténia és a kollinearitás között?
- Mind a szinténiában, mind a kollinearitásban két különböző faj lókuszkészlete ugyanazon a kromoszómán található.
- Ezek a kifejezések az ugyanazon a kromoszómán lévő genetikai lókuszok fizikai együttes lokalizációját írják le.
- A kollinearitás a szinténia egy specifikusabb formája.
- Néha mindkét kifejezést felcserélhetően használják a genomikában.
- Ha két régiónak kollinearitása van, akkor nyilvánvalóan szintenikusak.
- Hasznosak a törzsfejlődés megállapításában.
Mi a különbség a szinténia és a kollinearitás között?
A szinténia és a kollinearitás két olyan kifejezés, amelyeket felcserélhetően használnak a genomikában. A szinténia egy adott kromoszómában lévő génkészlet fizikai együttes lokalizációját jelenti különböző fajokban. A kollinearitás a szinténia egyik formája, amelyben a gének halmaza ugyanabban a sorrendben lokalizálódik a különböző fajok között. Ezért ez a legfontosabb különbség a szinténia és a kollinearitás között.
Összefoglaló – Synteny vs Collinearity
A szinténia és a kollinearitás kifejezések olyan gének halmazára utalnak, amelyek különböző fajokban ugyanazon a kromoszómán találhatók. Valójában ezek a gének különböző fajokban ugyanabban a kromoszómában lokalizálódnak. A szinténia leírja a különböző fajok ugyanazon a kromoszómán lévő gének együttes lokalizációját, míg a kollinearitás a szinténia egy specifikusabb formája, amelyben a gének halmaza ugyanabban a sorrendben lokalizálódik. Így ez összefoglalja a szinténia és a kollinearitás közötti különbséget.
