A legfontosabb különbség a xilol-cianol és a brómfenolkék között az, hogy 1%-os agarózgélben a xilol-cianol lassabban, míg a bróm-fenolkék gyorsabban vándorol.
A xilol-cianol és a brómfenolkék fontos színjelzők, amelyek felhasználhatók az agaróz gélelektroforézis és a poliakrilamid gélelektroforézis folyamatának nyomon követésére.
Mi az a xilol-cianol?
A xilol-cianol egy elektroforetikus színjelölő vagy nyomkövető festék. Hasznos az agaróz gélelektroforézis és a poliakrilamid gélelektroforézis folyamatának nyomon követésére. Ha ezt az anyagot összekeverjük a mintával, ennek az anyagnak a koncentrációja általában körülbelül 0 lesz.005%-tól 0,03%-ig. A xilol-cianolra használható szinonimák közé tartozik az Acid Blue 147, a xilol-cianol, a xilol-cianol FF, a xilol-cianol FF stb.
Ennek a vegyületnek a kémiai képlete: C25H27N2NaO 6S2 A xilol-cianol moláris tömege 538,61 g/mol. Ez az anyag körülbelül 4-5 kilobázispárnyi DNS-fragmentumot tud vándorolni 1%-os agaróz gélekben. Ez azonban az általunk használt puffertől függ. A xilol-cianol 6%-os poliakrilamid gélen jellemzően körülbelül 140 bázispár DNS-fragmens sebességgel tud vándorolni. Másrészt 20%-os denaturáló poliakrilamid gélelektroforézisben 25 bázisos oligonukleotid sebességgel vándorol.
A xilol-cianol hidrogénkötés-donorainak száma 2 m, a hidrogénkötés-akceptorok száma pedig 8. Ennek a vegyületnek a forgatható kötésszáma 7. A xilol-cianol komplexitása 1120 fokkal írható le. Meghatározott kötési sztereocentrum-száma 1.
Mi az a brómfenolkék?
A brómfenolkék hasznos pH-indikátor, amely elektroforetikus színjelölőként és festékként is használható. A kémiai neve 3’, 3”, 5’, 5”-tetrabrómfenolszulfonftalein, BPB. Ennek a vegyületnek a kémiai képlete: C19H10Br4O5 S. Ennek a vegyületnek a moláris tömege 669,96 g/mol. Szagtalan, sűrűsége 2,2 g/ml. Olvadáspontja 273 Celsius-fok, forráspontja 279 Celsius-fok. Elkészíthetjük úgy, hogy a fenolszulfonftalein jégecetben készült forró oldatához lassan adagoljuk a felesleges brómot.
A brómfenolkék hasznos sav-bázis indikátorként a pH 3,0 és 4,6 közötti tartományban. Képes sárgáról pH 3,0-nál 4,6-ra változni. Ráadásul ez egy reverzibilis reakció. Szerkezetileg a bróm-fenolkék hasonló a fenolftaleinhez.
Emellett színjelölőként is használhatjuk az agaróz gélelektroforézis és a poliakrilamid gélelektroforézis folyamatának nyomon követésére. Ez az anyag mérsékelt pH-értéken negatív töltést hordozhat, ahol a DNS-sel vagy fehérjével azonos irányba vándorolhat a gélben. A migrációs sebesség a gél sűrűségétől és a puffer összetételétől függően változhat. Azonban egy tipikus 1% agaróz gélben 1-szeres TAE-pufferben vagy TBE-pufferben ez az anyag ugyanolyan sebességgel vándorol, mint egy körülbelül 300 bázispárból álló DNS-fragmens.
Mi a különbség a xilol-cianol és a brómfenolkék között?
A xilol-cianol és a brómfenolkék fontos színjelzők. A legfontosabb különbség a xilol-cianol és a bróm-fenolkék között az, hogy 1%-os agarózgélben a xilol-cianol lassabban, míg a bróm-fenolkék gyorsabban vándorol.
Az alábbiakban összefoglaljuk a xilol-cianol és a bróm-fenolkék közötti különbséget táblázatos formában az egymás melletti összehasonlításhoz.
Összefoglaló – Xilol-cianol vs brómfenolkék
A xilol-cianol és a bróm-fenolkék fontos színjelzők, amelyeket az agarózgél-elektroforézis és a poliakrilamid-gélelektroforézis folyamatának nyomon követésére használnak. A legfontosabb különbség a xilol-cianol és a bróm-fenolkék között az, hogy 1%-os agarózgélben a xilol-cianol lassabban, míg a bróm-fenolkék gyorsabban vándorol.
