A replikatív transzpozíció és a kivágás és beillesztés közötti fő különbség az, hogy a replikatív transzpozíció során a transzpozon egy új helyre másolódik, míg a kivágás és beillesztés esetén a transzpozon egy új helyre kerül.
A transzponálható elemek vagy ugrógének olyan DNS-szekvenciák, amelyek megváltoztathatják pozíciójukat a genomon belül. Ezt átültetésnek nevezik. A transzpozíció néha mutációkat hozhat létre vagy visszafordíthat, és megváltoztathatja a sejt genetikai azonosságát és genomméretét. Az átültetést Barbara McClintock fedezte fel 1983-ban. Az átültetés két technikával történhet: sokszorosítással, kivágással és beillesztéssel.
Mi az a replikatív átültetés?
A replikatív transzponálás az átültetési mechanizmus egy olyan típusa, amely replikált vagy duplikált technikával segíti a kivágást a natív helyről a másikra. Ezt a mechanizmust először James A Shapiro találta meg 1979-ben. Ebben a mechanizmusban az átültethető elem megkettőződik az átültetési reakció során, így a transzponáló entitás az eredeti elem másolata. Sőt, ebben a mechanizmusban a donor és a receptor DNS-szekvenciák jellegzetes köztes „théta” konfigurációt alkotnak, amelyet Shapiro intermediernek (kointegrációnak) neveznek. A replikatív transzpozíció jellegzetes retrotranszpozon. Ez a mechanizmus általában az I. osztályú transzpozonokban fordul elő.
01. ábra: Replikatív átültetés
A replikatív transzpozíció jó példája megfigyelhető az E. coli TN3 transzpozonban. A TN3 transzpozon replikált vagy duplikált technikával az eredeti plazmidból egy másik célplazmidba léphet. Ezt az egész eseményt két fontos enzim, a transzpozáz és a rezolváz közvetíti. Továbbá replikatív transzpozíció megfigyelhető mind a DNS-transzpozonokban, mind a retropozonokban. A legjobban tanulmányozott transzponálható bakteriális vírus a Mu bakteriofág.
Mi az a kivágás és beillesztés átültetés?
A kivágás és beillesztés transzponálás egy olyan transzpozíciós mechanizmus, amely segít a kivágás és beillesztés technikával a natív helyről a másikra történő kivágásban. Ezt a mechanizmust az átültetés konzervatív modelljének is nevezik. Ebben a nem replikatív transzpozícióban a transzpozon kivágása és integrációja egyik genomi helyről a másikra anélkül megy végbe, hogy másolatot hagyna hátra.
02. ábra: Kivágás és beillesztés átültetés
Ebben a mechanizmusban a transzpozáz enzim először a terminális ismétlődésekhez kötődik, amelyek általában a transzpozonok mindkét végén jelen vannak, majd szinaptikus komplexnek (transzpozoszómának) nevezett szerkezetet alkot. A szinaptikus komplex lehasítja a transzpozont az eredeti genomi helyéről, és integrálja az új célhelyre. Ezt követően a transzpozázok a transzpozon mindkét végéről távoznak. Amint a transzpozáz enzim elhagyja a transzpozont, a hézagokat a gazda-polimeráz enzim kitölti. Ez lehetővé teszi a transzpozon teljes csatlakozását az új genomi helyhez. Ez a mechanizmus általában a II. osztályú transzpozonokban fordul elő. Ezen túlmenően a TN5 bakteriális transzpozonok jól ismert példák, amelyek konzervatív vagy cut and paste transzpozíciós mechanizmust mutatnak.
Melyek a hasonlóságok a replikatív transzponálás és a kivágás és beillesztés között?
- A replikatív transzponálás és a kivágás és beillesztés kétféle transzponálási mechanizmus.
- Mindkét mechanizmusban a transzponálható elemek egyik genomi helyről egy másik új genomi helyre költöznek.
- Mindkét mechanizmus mutációkat hozhat létre vagy visszafordíthat, és megváltoztathatja a sejt genetikai identitását.
- A bakteriális transzpozonok mindkét mechanizmust mutatják.
- Rendkívül fontos események az evolúció szempontjából.
Mi a különbség a replikatív transzponálás és a kivágás és beillesztés között?
A replikatív transzpozíció a transzpozíciós mechanizmus egy olyan típusa, ahol a transzpozont egy új helyre másolják, míg a kivágás és beillesztés transzpozíció egy olyan transzpozíciós mechanizmus, ahol a transzpozont új helyre helyezik át. Így ez a legfontosabb különbség a replikatív transzponálás és a kivágás és beillesztés között. Ezenkívül a replikatív transzpozíció általában az I. osztályú transzpozonokban történik, míg a kivágás és beillesztés általában a II. osztályú transzpozonokban történik.
Az alábbi infografika bemutatja a replikatív átültetés és a kivágás és beillesztés közötti különbségeket táblázatos formában, egymás melletti összehasonlítás céljából.
Összefoglaló – Replikatív átültetés vs kivágás és beillesztés átültetés
A replikatív transzponálás és a kivágás és beillesztés kétféle transzponálási mechanizmus. A replikatív transzpozíció a transzpozíciós mechanizmus egy olyan típusa, ahol a transzpozont egy új helyre másolják, míg a kivágás és beillesztés transzpozíció egy olyan típusú transzpozíciós mechanizmus, ahol a transzpozon egy új helyre kerül. Tehát ez összefoglalja a replikatív transzponálás és a kivágás és beillesztés közötti különbséget.