A legfontosabb különbség a DNS és a fehérje microarray között az, hogy a DNS microarray szilárd felülethez, például üveglemezhez kapcsolódó, mikroszkopikus DNS-foltok gyűjteménye, míg a protein microarray tisztított fehérjék elrendezése szilárd felületen, mint egy üveg. dia.
A Microarray egy chip (LOC) eszközön található laboratórium. Ez egy miniatűr, multiplex, párhuzamos feldolgozó és érzékelő eszköz. Ez is egy kétdimenziós tömb szilárd felületen, például üveglemezen vagy szilícium vékonyréteg cellán. A microarray nagy mennyiségű biológiai anyagot vizsgál nagy áteresztőképességű szűréssel. Az első microarray a Tse Wen Chang által 1983-ban bemutatott antitest chip volt. Az első génchipet 1995-ben Ron Davis és Pat Brown vezette be a Stanford Egyetemen. Ezért a DNS és a protein microarray kétféle microarray eszköz.
Mi az a DNS Microarray?
DNS microarray mikroszkopikus DNS-foltok gyűjteménye, amelyek szilárd felülethez, például tárgylemezhez kapcsolódnak. A tudósok DNS microarray segítségével mérik egyidejűleg nagyszámú gén expresszióját. Egy genom több régiójának genotipizálására is használják. A DNS microarray-t robotgépekkel készítik el. Ezek a gépek több száz vagy több ezer génszekvenciát (próbát) rendeznek el egyetlen mikroszkopikus tárgylemezen.
01. ábra: DNS Microarray
A DNS-mikromátrixban minden DNS-folt pikomolokat (10−12 mól) tartalmaz egy adott DNS-szekvenciából. Ezeket a DNS-szekvenciákat próbáknak vagy riportereknek is nevezik. Ezek a próbák egy gén vagy más DNS-elem rövid DNS-szegmensei. Nagy sztringens körülmények között képesek hibridizálni a mintában lévő cDNS-sel vagy CRNS-sel. A próbákhoz kötődő fluoreszcensen jelölt mintaszekvenciák olyan jeleket generálnak, amelyek a hibridizációs körülményektől, például a hőmérséklettől függenek. Ezért ez a módszer használható a mintában lévő nukleinsavszekvenciák relatív mennyiségének meghatározására. Ezenkívül a DNS microarray technikát széles körben alkalmazzák génexpressziós vizsgálatokban, összehasonlító genomikai vizsgálatokban, élelmiszerek vagy sejttenyészetek kórokozókkal való szennyezettségének ellenőrzésében, génmutációk kiértékelésében, gyógyszerjelöltek azonosításában, genetikai kapcsolat elemzésében stb.
Mi az a Protein Microarray?
A protein microarray tisztított fehérjék elrendezése szilárd felületen, például tárgylemezen. Ez egy módszer a fehérjék kölcsönhatásának és aktivitásának kimutatására. A fehérjék funkcióinak nagy léptékű meghatározására is használják. A protein microarray fő előnye, hogy nagyszámú fehérje párhuzamosan nyomon követhető. A protein microarray egy chip, amely hordozófelületből, például tárgylemezből, nitrocellulóz membránból, gyöngyből vagy mikrotitráló lemezből áll. A befogó fehérjék (antitestek, antigének) ehhez a szilárd felülethez kötődnek. Az általában fluoreszcens festékkel jelölt próbamolekulákat később adják hozzá a tömbhöz. A próba és az immobilizált fehérjék közötti hibridizáció fluoreszcens jelet bocsát ki, amely lézerszkennerrel detektálható.
02. ábra: Protein Microarray
Az első fehérjetömb egy antitest-microarray (antitestmátrix), amelyet 1983-ban vezettek be. A protein microarray-ek gyorsak, automatizáltak, nagyon érzékenyek és gazdaságosak. Emellett csak kis mennyiségű mintát és reagenst fogyasztanak. Ezenkívül a protein microarray-eket széles körben alkalmazzák a betegségek diagnosztizálására, a fehérje funkcionális elemzésére, az antitestek jellemzésére és a kezelés fejlesztésére.
Mi a hasonlóság a DNS és a fehérje mikromátrix között?
- DNS és protein microarray kétféle microarray eszköz.
- Mindkét eszköz a hibridizációs elven alapul.
- Mindkét eszköz szondákat használ.
- Fluoreszcens jeleket is használnak a hibridizáció kimutatására.
- Mindketten rendkívül hasznosak a betegségek diagnosztizálásában az orvostudományban.
Mi a különbség a DNS és a Protein Microarray között?
DNS microarray mikroszkopikus DNS-foltok gyűjteménye, amelyek szilárd felülethez, például tárgylemezhez kapcsolódnak. Ezzel szemben a protein microarray tisztított fehérjék elrendezése szilárd felületen, például tárgylemezen. Tehát ez a legfontosabb különbség a DNS és a fehérje microarray között. Továbbá egy DNS-mikroarray-ben a minta és a próba DNS-szekvenciák. Másrészt a protein microarray-ben a minta és a próba fehérjék.
A következő infografika táblázatos formában mutatja be a DNS és a fehérje microarray közötti különbségeket.
Összefoglaló – DNS vs Protein Microarray
A microarray egy nagy áteresztőképességű és multiplex lab-on-a-chipen. A hibridizációs elv alapján készül. A DNS és a protein microarray kétféle microarray eszköz. A DNS microarray egy szilárd felülethez, például egy tárgylemezhez kapcsolódó, mikroszkopikus DNS-foltok gyűjteménye. Másrészt a protein microarray tisztított fehérjék elrendezése szilárd felületen, például egy tárgylemezen. Így ez a DNS és a fehérje microarray közötti különbség összefoglalása.