A fő különbség a CRISPR és a CRISPR Cas9 között az, hogy a CRISPR (csoportos, szabályosan interspaced short palindromikus ismétlés) egy természetesen előforduló prokarióta immunvédelmi mechanizmus, míg a CRISPR cas9 egy RNS-vezérelt Cas9 nukleáz, amely a CRISPR adaptív része. immunrendszer.
A CRISPR egy vírusellenes védekező immunrendszer, amely baktériumokban és archaeában található. Ez a baktérium genomjában található DNS-szekvenciák családja. Olyan spacer szekvenciákból áll, amelyek olyan bakteriofágok DNS-fragmenseiből származnak, amelyek korábban megfertőzték őket. A következő vírusfertőzések során a baktériumok ezeket a szekvenciákat használják a vírus DNS elpusztítására. A CRISPR szekvenciák rövid palindrom ismétlődésekkel és spacer szekvenciákkal rendelkeznek. Ezenkívül a CRISPR ismétlődő spacer szekvenciák gyakran tartalmaznak olyan géneket, amelyek Cas-fehérjéket kódolnak. A Cas9 egy RNS által irányított endonukleáz. A CRISPR szekvenciákkal együtt a Cas9 fehérje adaptív immunrendszerként működik a baktériumokban a bakteriofágok ellen.
Mi az a CRISPR?
A CRISPR a Clustered Regularly Interspaced Short palindromic Repeats rövidítése. Ez a bakteriális genomban található DNS-szekvenciák klasztere. Természetes védekező mechanizmusként működik a baktériumokban, és először E. coliban azonosították. Baktériumokban adaptív immunvédelemként működik, különösen a bakteriofágok ellen. Ezért ez egy szekvencia-specifikus mechanizmus.
01. ábra: CRISPR
A CRISPR rendszer több rövid szegmensű DNS ismétlődő szekvenciát tartalmaz. Ezek az ismétlődések palindromikusak, 5'-től 3'-ig olvasáskor azonos bázissorrenddel rendelkeznek, míg a másik ugyanazt a szekvenciát adja, amikor 3'-től 5'-ig olvas. Ráadásul az ismétlések azonosak. Rövid „távtartó” DNS-szekvenciák között helyezkednek el, amelyek nem azonosak. De ezek a spacer DNS-szekvenciák hasonlóak vagy egyeznek az idegen bakteriofág DNS-sel. A CRISPR-hez kapcsolódó géneket CRISPR-hez kapcsolódó géneknek vagy Cas-géneknek nevezzük. A Cas gének Cas fehérjéket kódolnak, amelyek helikázok vagy nukleázok. A helikázok letekerik a DNS-t, míg a nukleázok elvágják a DNS-t. Összességében, ha figyelembe vesszük a CRISPR-t, ez a baktériumok immunrendszere, amely a bakteriofágok (baktériumokat fertőző vírusok) ellen dolgozik.
Mi az a CRISPR Cas9?
A Cas9 vagy CRISPR-hez kapcsolódó protein 9 egy bakteriális RNS által irányított endonukleáz. Ezért ez egy olyan enzim, amely felismeri és levágja a cél-DNS-t (különösen a bakteriofág DNS-t), amely komplementer a vezető RNS-sel. Szálspecifikus hasítást hajt végre. A Cas9 fehérjét egy CRISPR-hez kapcsolódó gén kódolja. A CRISPR cas9 egy RNS-vezérelt CRISPR-Cas9 nukleázrendszer, amely RNS-sel programozható DNS-célzó és -szerkesztő platformként használható genomszerkesztéshez, transzkripciós perturbációhoz, epigenetikai modulációhoz és genom képalkotáshoz. Ez a CRISPR cas9 rendszer nagyon népszerű a jelenlegi genomszerkesztő rendszerekben.
02. ábra: CRISPR Cas9
Jelenleg a CRISPR/Cas9 rendszert az emlős genom megváltoztatására vagy módosítására használják transzkripciós elnyomással vagy aktiválással. Az emlőssejtek a CRISPR/Cas9 által közvetített DNS-törésekre egy javító mechanizmus alkalmazásával reagálhatnak. Ez történhet nem homológ végcsatlakozási módszerrel (NHEJ) vagy homológia irányított javítással (HDR). Mindkét javítási mechanizmus kétszálú törések bevezetésével valósul meg. Ez emlős génszerkesztést eredményez. Az NHEJ génmutációk ablációjához vezethet, és felhasználható a funkcióvesztési hatások létrehozására. A HDR specifikus pontmutációk vagy változó hosszúságú DNS-szegmensek bejuttatására használható. Jelenleg a CRISPR/Cas rendszert a terápiás, orvosbiológiai, mezőgazdasági és kutatási alkalmazások területén használják.
Mi a hasonlóság a CRISPR és a CRISPR Cas9 között?
- A Cas9 a CRISPR Cas rendszer része.
- A Crisper cas9 rendszer a baktériumokban természetesen megtalálható immunrendszer.
Mi a különbség a CRISPR és a CRISPR Cas9 között?
A CRISPR a bakteriális genomban található DNS-szekvenciák csoportja, amely természetes védekező rendszerként működik a bakteriofágok ellen. Rendszeresen elhelyezkedő rövid palindrom ismétlődésekből, spacerekből és kapcsolódó génekből áll. Ezzel szemben a cas9 egy CRISPR-hez kapcsolódó 9-es fehérje, amely egy RNS által irányított endonukleáz enzim. Felismeri és hasítja a vírusok kettős DNS-szálát. Valójában a CRISPR védelmi rendszer része. Tehát ez a legfontosabb különbség a CRISPR és a CRISPR cas9 között.
Összefoglaló – CRISPR vs CRISPR Cas9
A CRISPR Cas rendszer egy mikrobiális védekező rendszer. A CRISPR DNS-szekvenciák csoportja, amely palindromikus rövid ismétlődésekből, spacer szekvenciákból és kapcsolódó génekből áll. A Cas9 egy Cas fehérje, amely egy RNS által irányított endonukleáz. A CRISPR és a Cas9 fehérje olyan immunrendszert hoz létre, amely a baktériumok bakteriofág fertőzései ellen hat. A Cas9 fehérje képes az idegen vírus DNS-ét hasítani és megzavarni. A CrRNS irányítja a ca9-et a vírus DNS felismeréséhez. Ezért a CRISPR cas9 rendszer a baktériumokban található természetes immunrendszer a vírusok ellen. Így ez a CRISPR és a CRISPR cas9 közötti különbség összefoglalása.
