A fő különbség a motívum és a tartomány között az, hogy a motívum egymástól függetlenül nem stabil, míg a tartomány egymástól függetlenül stabil.
A fehérjék fontos biológiai makromolekulák, amelyek testünkben jelen vannak. Másrészt a gén genetikai kódja határozza meg a fehérje aminosavszekvenciáját. Ezenkívül a fehérjék elsődleges, másodlagos és harmadlagos szerkezettel rendelkeznek. Az elsődleges szerkezet a polipeptid lánc aminosavszekvenciája. Amikor a polipeptid láncok összehajtogatják egymást, ez képezi a fehérje másodlagos szerkezetét. A másodlagos struktúrákhoz alfa-hélixek, béta-lapok és szuperszekunder struktúrák tartoznak. A szuperszekunder elemek bizonyos csoportjai fehérje motívumként ismertek. A fehérje harmadlagos szerkezete annak háromdimenziós szerkezetére utal, amely meghatározza a fehérje működését. A domén egy fehérjemolekula hajtogatott szakasza, amely gömb alakú és különálló funkcióval rendelkezik. Ez a fehérje alapvető funkcionális és háromdimenziós szerkezete.
Mi az a motívum?
A motívum a fehérjék szuperszekunder elemeinek egy bizonyos csoportja, mint például az alfa-hélixek és a béta-struktúrák. Ezek valamiféle mintázatok, amelyek különböző fehérjékben jelen vannak. A motívumok a másodlagos szerkezeti elemek összehajtási mintázatait és kölcsönhatásait írják le. Ezek a hajtogatási minták a harmadlagos struktúrákban jelen lévő hasonló kapcsolatok révén stabilizálódnak. Ezek azonban nem olyan összetettek, mint a harmadlagos struktúrák.
01. ábra: Motívum
Ezek a fehérjék másodlagos szerkezeteinek egyszerű kombinációi. A motívum önmagában nem stabil. Ezenkívül a motívumok megmagyarázzák a fehérje szerkezetét, de nem jósolják meg a fehérje működését. A fehérje motívumokra példa a béta-alfa-béta motívum, a görög kulcsmotívum, a béta hordó, a béta-meander motívum stb.
Mi az a domain?
A tartomány a fehérje alapvető, funkcionális és háromdimenziós egysége. Egy adott funkciót lát el. Egy fehérjének több különálló doménje lehet. Minden tartomány független egység. Ez egy gömb alakú szerkezet. Egy adott funkcióért vagy interakcióért felelős. A domének segítségével feltételezhető egy nem jellemzett fehérje funkciója. Egy fehérje elemzése során elengedhetetlen figyelembe venni, mivel a domének a fehérje funkcionális egységei.
02. ábra: A piruvát-kináz három különböző tartománya
A tartományok nagyon stabil és kompakt struktúrák. Könnyen megkülönböztethetők más régióktól. A piruvát-kináznak három megkülönböztető doménje van, amint az a 02. ábrán látható. A domén hossza változhat, és az átlagos hossza 100 aminosav. Minden tartomány tartalmaz egy hidrofób magot, amely másodlagos szerkezeti egységekből épül fel. Számos domén együttesen alkotja egy fehérje harmadlagos szerkezetét.
Mi a hasonlóság a motívum és a domain között?
- A motívum és a domén egységek, amelyek magukban a fehérjemolekulákban jelen vannak.
- Hasznosak a fehérjecsaládok osztályozásakor.
Mi a különbség a motívum és a domain között?
A motívum a fehérjék szuperszekunder elemeinek egy bizonyos csoportja, mint például az alfa-hélixek és a béta-struktúrák, míg a domén a fehérje funkcionális egysége. Ezenkívül a motívum egy másodlagos szerkezet, míg a domén felelős a fehérje harmadlagos szerkezetéért. Ráadásul a tartomány független egység, ellentétben a motívummal. Ezenkívül a domén egy fehérje funkcióját ábrázolja, míg a motívum nem. Ezek a fő különbségek a motívum és a tartomány között. Az alábbi infografika táblázatos formában mutatja be a különbséget a motívum és a domain között.
Összefoglaló – Motívum vs Domain
A motívum a fehérjemolekula másodlagos szerkezeteinek elrendezése. Általában nem stabil önmagában, ellentétben a tartományokkal. A domén egy fehérje egymástól függetlenül stabil szerkezete. Ezért lehet egy része vagy egész fehérjemolekula. Ez a fehérje háromdimenziós alapvető funkcionális egysége. Sőt, funkciója is van, és önálló egység. A motívum a tartomány része lehet. De a domain nem lehet egy motívum része. Ez a különbség a motívum és a domain között.