A poliszóma profilalkotás és a riboszóma profilalkotás közötti fő különbség az, hogy a poliszóma profilalkotás a riboszóma viselkedését riboszóma és mRNS (poliszóma) segítségével elemzi a transzláció során, míg a riboszóma profilalkotás a riboszóma viselkedését csak az mRNS szekvencia felhasználásával elemzi a transzláció során.
A transzláció a fehérjeszintézis második fázisa, amely az mRNS-ben lévő információt aminosavszekvenciává alakítja. A Translatomics az ORF-ek (nyílt olvasási keretek) tanulmányozása, amelyek aktívan lefordíthatók egy szervezet sejtjében. A poliszóma és riboszóma profilalkotási technikák kétféle technikát jelentenek a molekuláris biológia területén, amelyek segítségével a transzlatom elemzésével összefüggésben különböző paramétereket értékelnek és következtetnek.
Mi az a poliszóma profilozás?
A poliszóma profilalkotás egy olyan technika, amely a riboszóma és az mRNS (poliszóma) viselkedésének elemzésével következtet egy specifikus mRNS transzlációjának állapotára. Más szavakkal, ez a technika adatokat és következtetéseket szolgáltat az mRNS-ek riboszómákkal való asszociációjáról. A poliszóma a transzláció elongációs fázisában jelen lévő mRNS-hez kötődő riboszómák csoportjára utal.
01. ábra: Poliszóma profilozás
A poliszóma profilalkotáshoz sejtlizátumra van szükség, amelyet ezután centrifugálnak. A centrifugált mintát ezután sűrűségük alapján szétválasztják, hogy jellemezzék a riboszómák kis és nagy alegységeit és a megfelelő mRNS-t, amely részt vesz a poliszóma kialakulásában. Ezenkívül az eljárás magában foglalja az optikai sűrűség mérését is. Szakértőkre van szükség a poliszóma profilalkotás elvégzéséhez.
A poliszóma profilalkotási technika számos alkalmazás fontos eszköze. A tudósok ezt a technikát használják a transzláció mértékének tanulmányozására a sejtekben. Pontosabban, ez egy olyan eszköz, amely pontos információkat nyújt az egyes fehérjék és specifikus mRNS-eik tanulmányozásáról. Egy adott mRNS transzlációjának mértékének tanulmányozása során a poliszóma profilalkotási technika létfontosságú. Itt egy mRNS 3' és 5' szekvenciája vizsgálható a termelt mRNS mennyiségére és a transzláció szintjére gyakorolt hatásuk alapján.
Mi az a riboszóma profilozás?
A riboszóma profilalkotás egy olyan technika, amely elemzi a riboszóma viselkedését az mRNS-hez képest a transzláció során. Ezt a technikát Joan Steitz és Marilyn Kozak találta meg és fejlesztette ki. Később ezt a technológiát két tudós, Nicholas és Jonathan fejlesztette tovább, a következő generációs szekvenálással kombinálva, ami különböző kapcsolódó technikák kifejlesztéséhez vezetett, mint például a Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP) módszertan.
02. ábra: Riboszóma szekvenálás
A riboszóma profilalkotás eljárása magában foglalja az mRNS izolálását, a riboszómákhoz nem kötődő RNS eltávolítását és a riboszómákhoz kötött mRNS szétválasztását. Ezt az eljárást követően az mRNS-izolátum reverz átírása megtörténik, és megtörténik a cDNS-szintézis. Végül a szekvenciaadatokat a transzlációs profilhoz lehet igazítani, hogy levonhassuk a riboszóma viselkedésének jellemzőit az mRNS-sel kapcsolatban.
A riboszóma profilalkotás sok kutatónak segít azonosítani és következtetni a transzláció kezdőhelyeinek helyére, a transzlált nyílt leolvasási keretek (ORF-ek) komplementerére egy sejtben vagy szövetben, a riboszómák eloszlására az mRNS-en és a transzláció sebességére. riboszómák fordítása. A riboszóma profilalkotás riboszóma lábnyomként vagy Ribo Seq. néven is ismert
Mi a hasonlóság a poliszóma profilozás és a riboszóma profilozás között?
- A poliszóma és riboszóma profilalkotás a kutatásban fontos molekuláris biológiai technikák.
- Információt nyújtanak a fordítási folyamatról.
- Mindkét profilalkotási folyamat a fordítóelem elemzésén keresztül szolgáltat adatokat.
- A pontos eredmények érdekében mindkét technika elvégzéséhez professzionális szakértőkre van szükség.
- A bioinformatikai eszközök mindkét technikában fontos szerepet játszanak.
Mi a különbség a poliszóma profilozás és a riboszóma profilozás között?
A poliszóma profilalkotás a riboszóma viselkedését riboszóma és mRNS (poliszóma) felhasználásával elemzi a transzláció során, míg a riboszóma profilalkotás a riboszóma viselkedését csak az mRNS szekvencia felhasználásával elemzi a transzláció során. Így ez a legfontosabb különbség a poliszóma profilalkotás és a riboszóma profilalkotás között. Ezenkívül a poliszóma profilalkotás olyan technikákat foglal magában, mint a sűrűséggradiens centrifugálás és az optikai sűrűségmérés, míg a riboszóma profilalkotás mRNS extrakciót és szekvenálási technikákat foglal magában. Ezenkívül a riboszóma profilalkotás pontosabb, mint a poliszóma profilalkotás.
Az alábbi infografika táblázatos formában mutatja be a poliszóma- és riboszómaprofilok közötti különbségeket egymás melletti összehasonlítás céljából.
Összefoglaló – Poliszóma profilozás vs riboszóma profilozás
A transzláció a fehérjeszintézis második fázisa, amely magában foglalja az mRNS-szekvencia információinak aminosavszekvenciává történő átalakítását. Ez a folyamat mRNS-templátot, riboszómákat, aminosavakat, tRNS-t és más tényezőket igényel. A poliszóma és a riboszóma profilalkotás két molekuláris technika. A poliszóma profilalkotás a riboszóma viselkedését riboszóma és mRNS (poliszóma) felhasználásával elemzi a transzláció során, míg a riboszóma profilalkotás a riboszóma viselkedését csak az mRNS szekvencia felhasználásával elemzi a transzláció során. A poliszóma profilalkotás olyan technikákat foglal magában, mint a sűrűséggradiens centrifugálás és az optikai sűrűségmérés. A riboszóma profilalkotás olyan technikákat foglal magában, mint az mRNS extrakció, cDNS szintézis és szekvenálás. Tehát ez összefoglalja a poliszóma profilalkotás és a riboszóma profilalkotás közötti különbséget.
