A legfontosabb különbség a fehérje alegység és a domén között az, hogy a fehérje alegység egy fehérje különálló polipeptid lánca, amely más polipeptid láncokkal összeáll, és fehérjekomplexet képez, míg a fehérje domén a polipeptid lánc egy összefüggő régiója egy fehérje, amely gyakran önállóan hajtódik össze kompakt, helyi és félig független egységgé.
A fehérje alegysége és doménje nagyon fontos részei a multimer fehérjéknek. A fehérjék polipeptidekből készült polimerek. Mindegyik polipeptidlánc egy aminosavként ismert monomerből épül fel. Egy komplex fehérje különálló szerkezeti egységeket tartalmaz, például alegységeket, doméneket, motívumot és foldet. Egy összetett fehérje ezen szerkezeti egységei rendkívül fontosak szerkezete és végső soron működése szempontjából.
Mi az a fehérje alegység?
A fehérje alegység egy fehérje különálló polipeptid lánca, amely más polipeptid láncokkal összeáll és fehérjekomplexet alkot. A szerkezetbiológiában a fehérje alegység egyetlen fehérjemolekula, amely más fehérjemolekulákkal együtt fehérjekomplexet képez. A természetben előforduló fehérjéknek viszonylag kis számú alegységük van, mint például a hemoglobin és a DNS-polimeráz. Ezért oligomernek nevezik őket. Más fehérjék nagyszámú alegységből állnak, ezért multimernek nevezik őket. Például a mikrotubulusok és más citoszkeleton fehérjék multimerek. A multimer fehérje alegységei lehetnek azonosak (homológok) vagy teljesen eltérőek (heterológok).
01. ábra: Fehérje alegység
Egyes multimer fehérjékben az egyik alegység lehet katalitikus alegység. Másrészt a másik egy szabályozó alegység. A katalitikus alegység funkciója az enzimreakció katalizálása, míg a szabályozó alegység funkciója az aktivitás elősegítése vagy gátlása. Az olyan enzimet, amely összeállítva katalitikus és szabályozó alegységekből is áll, általában holoenzimnek nevezik. Például az I. osztályú foszfoinozitid-3-kináz enzimnek van egy p110 katalitikus alegysége és egy p85 szabályozó alegysége. Ezenkívül egy fehérjének minden alegységhez egy gént kell tartalmaznia. Ennek az az oka, hogy egy alegység egy különálló polipeptidláncból áll, amely egy kódoló gént tartalmaz.
Mi az a fehérjedomain?
A fehérjedomén egy fehérje polipeptidláncának egy összefüggő régiója, amely gyakran önállóan hajtódik össze kompakt, lokális és félig független egységekre. A fehérje doménje a fehérje polipeptidláncának olyan régiójaként is ismert, amely önstabilizáló, és a többitől függetlenül hajtogat. Különálló szerkezeti és funkcionális egységet alkotnak a fehérjében. Normális esetben a domének felelősek egy adott funkcióért vagy kölcsönhatásért, amely hozzájárul a fehérje általános szerepéhez. Például az SH3 domén körülbelül 50 aminosavból áll. Különféle fehérjékben fordulnak elő, beleértve az adapterfehérjéket, a foszfatidil-inozitol-3-kinázokat, a foszfolipázokat és a miozinokat. Ezek az SH3 domének részt vesznek a fehérje-fehérje kölcsönhatásokban.
02. ábra: Fehérje tartományok
A domének hossza 50 aminosavtól 250 aminosavig terjed. A legrövidebb doméneket, például a cink ujját fémionok és diszulfid hidak stabilizálják. Egy domén gyakran termel funkcionális egységeket, például a kalmodulin kalciumkötő EF-kéz doménjét. Ezenkívül a domének géntechnológiával felcserélhetők egyik fehérje között kiméra fehérjék előállítására.
Mi a hasonlóság a fehérje alegység és a tartomány között?
- A fehérje alegység és a domén egy multimer fehérje szerkezeti egységei.
- Mindkettő aminosavakból áll.
- A „polipeptidlánc” kifejezéshez kapcsolódnak.
- Sőt, mindkettő rendkívül fontos a fehérje általános működése szempontjából.
Mi a különbség a fehérje alegység és a tartomány között?
A fehérje alegység egy fehérje különálló polipeptid lánca, amely más polipeptid láncokkal összeáll és fehérjekomplexet alkot. Másrészt a fehérjedomén egy fehérje polipeptid láncának egy összefüggő régiója, amely gyakran egymástól függetlenül hajtogatott kompakt, lokális és félig független egységekre. Tehát ez a legfontosabb különbség a fehérje alegység és a domén között. Ráadásul egy fehérje alegység mérete nagyobb, mint egy fehérjedomén.
A következő táblázat táblázatos formában foglalja össze a fehérje alegység és a domén közötti különbséget.
Összefoglaló – Protein Alegység vs Domain
A fehérjék építőkövei az aminosavak. A fehérjék aminosavak kondenzációjával jönnek létre. A fehérjeszerkezetek mérete tíztől több ezer aminosavig terjed. A fehérje szerkezetét nem kovalens kölcsönhatások, például hidrogénkötések, ionos kötések, Van der Waals-erők, hidrofób kötések és kovalens kölcsönhatások, például diszulfid kötések stabilizálják. Egy komplex fehérje különálló szerkezeti egységeket tartalmaz, például alegységeket, doméneket, motívumot és foldet. A fehérje alegység egy fehérje különálló polipeptid lánca, amely más polipeptid láncokkal összeáll és fehérjekomplexet alkot. Másrészt a fehérjedomén a fehérje polipeptidláncának egy olyan régiója, amely önstabilizáló, és a többitől függetlenül hajtogat. Így ez a fehérje alegység és a domén közötti különbség összefoglalása.
