A legfontosabb különbség a guanidin-tiocianát és a guanidin-hidroklorid között az, hogy a guanidin-tiocianát erősebb fehérjedenaturálószer, amelyet gyakrabban használnak RNS-izoláláshoz, míg a guanidin-hidroklorid gyengébb fehérjedenaturálószer, amelyet kevésbé használnak az RNS-izoláláshoz.
A denaturáció az a folyamat, amelynek során a fehérjék elveszítik kvaterner szerkezetüket, harmadlagos szerkezetüket és másodlagos szerkezetüket, amelyek normális esetben natív állapotukban jelen vannak. Megvalósítható valamilyen külső feszültség vagy vegyületek, például erős sav vagy bázis, tömény szervetlen só, szerves oldószer (alkohol, kloroform), keveréssel, sugárzással vagy hő alkalmazásával. A guanidin-tiocianát és a guanidin-hidroklorid két különböző típusú fehérjedenaturálószer.
Mi az a guanidin-tiocianát?
A guanidin-tiocianát (GTC) egy erősebb fehérjedenaturáló szer, amelyet gyakrabban használnak RNS izolálására. Guanidinium-izotiocianát (GITC) néven is ismert. Mivel kaotrop szer, ez egy kémiai vegyület, amelyet rutinszerűen használnak általános fehérjedenaturálószerként. A kaotróp ágens egy vizes oldatban lévő molekula, amely megzavarhatja a vízmolekulák közötti hidrogénkötési hálózatot. Ez hatással van az oldatban lévő más molekulák, például makromolekulák, például fehérjék és nukleinsavak natív állapotának stabilitására azáltal, hogy gyengíti a hidrofób hatást. A kaotróp szerek, mint például a guanidin-tiocianát, csökkentik a vízmolekulák által alkotott fehérjék szerkezetének rendezettségét mind az ömlesztett, mind a hidrofób aminosavak körüli hidratáló héjban. Ez fehérjedenaturációt okozhat.
A guanidin-tiocianát felhasználható olyan vírusok hatástalanítására, mint például az influenza, amelyek olyan betegségeket okoznak, mint az 1918-as spanyolnátha. Ezért használható orvosi vagy kórházi beállításokban. Ezenkívül a guanidin-tiocianátot sejtek és vírusrészecskék lízisére is használják RNS- és DNS-extrakciókban. Itt a guanidin-tiocianát feladata a lizáló hatás elősegítése, valamint az RNáz enzimek és a DNáz enzimek aktivitásának megakadályozása denaturálással. Ezek az enzimek egyébként károsítanák a kivonatot (RNS vagy DNS).
Mi az a guanidin-hidroklorid?
A guanidin-hidroklorid (GdnHCl) egy gyengébb fehérjedenaturálószer, amelyet kevésbé gyakran használnak RNS izolálásra. Guanidinium-klorid (GdmCl) néven is ismert. Ez a guanidin hidroklorid sója. A guanidin-hidroklorid kaotróp, és az egyik denaturálószer, amelyet a fehérje feltekeredésének fizikai-kémiai vizsgálataiban használnak.
01. ábra: Guanidin-hidroklorid
A guanidin-hidroklorid emellett képes csökkenteni az enzimaktivitást és növelni a hidrofób molekulák oldhatóságát. Normális esetben a guanidin-hidroklorid magasabb koncentrációinál a fehérjék elveszítik rendezett szerkezetüket. A guanidin-hidroklorid ilyen koncentrációja mellett a fehérjék véletlenszerűen összetekerednek. Orvosi vagy kórházi környezetben a guanidin-hidroklorid az Eaton-Lambert-szindrómával összefüggő izomgyengeség és könnyű fáradékonyság tüneteinek csökkentésére javasolt. Ezenkívül a guanidin-hidroklorid mellékhatásai közé tartozik a periszt altika, a hasmenés és a halálos csontvelő-szuppresszió.
Mi a hasonlóság a guanidin-tiocianát és a guanidin-hidroklorid között?
- A guanidin-tiocianát és a guanidin-hidroklorid két különböző típusú fehérjedenaturálószer.
- Mindkét denaturálószer szerkezetében guanidin található.
- Kaotróp szerek.
- Mindkét denaturálószer használható RNS izolálására.
- Mindkettőt orvosi vagy kórházi környezetben használják.
Mi a különbség a guanidin-tiocianát és a guanidin-hidroklorid között?
A guanidin-tiocianát erősebb fehérjedenaturáló szer, amelyet gyakrabban használnak RNS-izolálásban, míg a guanidin-hidroklorid gyengébb fehérjedenaturálószer, amelyet ritkábban használnak RNS-izolálásban. Így ez a legfontosabb különbség a guanidin-tiocianát és a guanidin-hidroklorid között. Továbbá a guanidin-tiocianát kémiai képlete C2H6N4S, míg a kémiai képlete: A guanidin-hidroklorid CH5N3HCl.
Az alábbi infografika táblázatos formában mutatja be a guanidin-tiocianát és a guanidin-hidroklorid közötti különbségeket egymás melletti összehasonlítás céljából.
Összefoglaló – Guanidin-tiocianát vs guanidin-hidroklorid
A guanidin-tiocianát és a guanidin-hidroklorid két különböző típusú fehérjedenaturálószer. Mindkét denaturáns kaotróp. A guanidin-tiocianát erősebb fehérjedenaturáló szer, amelyet gyakrabban használnak RNS-izolálásban, míg a guanidin-hidroklorid gyengébb fehérje-denaturálószer, amelyet ritkábban használnak RNS-izolálásban. Tehát ez összefoglalja a guanidin-tiocianát és a guanidin-hidroklorid közötti különbséget.
