A fő különbség a szigma faktor és az rho faktor között az, hogy a szigma faktor a baktériumokban a transzkripció megindításához szükséges fehérje, míg a rho faktor a baktériumokban a transzkripció leállításához szükséges fehérje.
A szigma faktor és a rho faktor a bakteriális transzkripció két fontos tényezője. A bakteriális transzkripció egy olyan folyamat, amelyben a bakteriális DNS egy darabját egy újonnan készített mRNS-szálba (messenger RNS) másolják. Ezt a folyamatot egy RNS polimeráz néven ismert enzim katalizálja. A baktériumok nagymértékben támaszkodnak a transzkripcióra és a fordításra, hogy megfelelően reagáljanak környezetükre. A bakteriális RNS polimeráz egy magból és egy holoenzim szerkezetből áll. A mag tartalmazza a β, β′, α és 2ω alegységeket, míg a holoenzim a szigma faktort. Ezenkívül az RNS-polimeráz egy járulékos faktora, az úgynevezett rho-faktor is nagyon fontos a bakteriális transzkripció szempontjából.
Mi az a Sigma Factor?
A szigma faktor vagy specificitási faktor egy fehérje, amely a baktériumokban a transzkripció megindításához szükséges. Ez egy bakteriális transzkripciós iniciációs faktor. Ez a faktor lehetővé teszi az RNS polimeráz enzim kötődését a DNS egy specifikus régiójához, amelyet promoter régiónak neveznek a transzkripció során. A szigma faktor általában homológ az archaeális B transzkripciós faktorral és a TF11B eukarióta transzkripciós faktorral. Ezenkívül egy adott gén specifikus szigmafaktora a géntől és a környezeti jelektől függően változik. A promotereket az RNS-polimeráz választja ki a hozzá kapcsolódó szigmafaktortól függően.
01. ábra: Szigma faktor
A szigma faktor a növények kloroplasztiszában is megtalálható a plasztid által kódolt polimeráz (PEP) részeként. A szigma faktor és az RNS polimeráz együttesen RNS polimeráz holoenzimként ismert. A szigma faktor molekulatömege körülbelül 70 kDa. A transzkripció megindulása után a szigma faktor disszociál a komplexből. Ezután az RNS-polimeráz tovább nyúlik, amíg a transzkripció véget nem ér.
Mi az a Rho Factor?
A Rho faktor egy prokarióta fehérje, amely részt vesz a transzkripció leállításában. A Rho faktor általában a transzkripciós terminátor szünet helyéhez kötődik. Ez a hely az egyszálú RNS exponált régiója a nyitott leolvasási keret közelében, citozinban gazdag guaninszegény szekvenciáknál. A prokariótákban nélkülözhetetlen transzkripciós fehérje. Az Escherichia coliban a rho faktor körülbelül 274,6 kDa hexamer azonos alegységekből áll. Mindegyik alegység rendelkezik egy RNS-kötő doménnel és egy ATP-hidrolízis doménnel. Ráadásul az rho faktor funkciója a helikáz aktivitás.
02. ábra: Rho-faktor
A Rho faktor az RNS-molekulához kötődik, majd az ATPáz aktivitását felhasználva energiát biztosít az RNS-molekulák transzlokációjához. A Rho faktor addig hajtja végre a transzlokációt, amíg el nem éri az RNS-DNS helikális régiót, ahol kibontja a hibrid (RNS-DNS) duplex szerkezetet. Ez a folyamat szünetelteti az RNS-polimerázt a terminációs helyen, ami véget vet a transzkripciós folyamatnak.
Mi a hasonlóság a Sigma-faktor és a Rho-faktor között?
- A szigma faktor és a rho faktor a bakteriális transzkripció két fontos tényezője.
- Mindkettő csak a prokariótákban van jelen.
- Ezek aminosavakból álló fehérjék.
- Mindkettő nukleinsavkötő fehérje.
- A prokarióták nagymértékben támaszkodnak ezekre a tényezőkre, hogy olyan mRNS-t állítsanak elő, amely különleges fehérjéket tud előállítani, és segít nekik specifikusan reagálni a környezetükre.
Mi a különbség a Sigma-faktor és a Rho-faktor között?
A szigma faktor egy fehérje, amely a baktériumokban a transzkripció megindításához, míg a rho faktor a baktériumokban a transzkripció leállításához szükséges fehérje. Tehát ez a legfontosabb különbség a szigma faktor és a rho faktor között. Továbbá a szigma faktor egy DNS-kötő fehérje, míg a rho faktor egy RNS-kötő fehérje.
Az alábbi infografika táblázatos formában mutatja be a szigma faktor és az rho faktor közötti különbségeket egymás melletti összehasonlítás céljából.
Összefoglaló – Sigma Factor vs Rho Factor
A transzkripció az a folyamat, amelynek során a DNS-ben lévő információk egy új molekulába, az úgynevezett mRNS-be (hírvivő RNS) másolódnak. Ez az m-RNS végső soron egy specifikus fehérje előállításában vesz részt. A szigma faktor és a rho faktor a bakteriális transzkripció két fontos tényezője. Ezek fehérjék. A szigma faktor részt vesz a baktériumok transzkripciójának megindításában. A Rho faktor felelős a baktériumokban a transzkripció leállításáért. Így ez a szigma faktor és az rho faktor közötti különbség összegzése.