A legfontosabb különbség a Rho-függő és a Rho-független termináció között az, hogy a Rho-függő terminációban a Rho-faktor kötődik a transzkriptumhoz, és a transzkripciót a templát és a transzkriptum közötti hidrogénkötések megszakításával fejezi be, míg az Rho-független termináció a transzkripciót hajtű hurok szerkezetet, majd U-ban gazdag régiót hoz létre az átiratban.
A transzkripció a génexpresszió két szakaszának egyike. Ez az a folyamat, amely a gén DNS-szekvenciájában rejtett genetikai információból mRNS-szekvenciát állít elő. A transzkripció három lépésben megy végbe: iniciáció, elongáció és termináció. Az RNS polimeráz enzim a gén promoter szekvenciájához kötődik, és elkezdi katalizálni az RNS szál szintézisét. Amíg meg nem találjuk a terminátorszekvenciát, az RNS-polimeráz nukleotidokat ad hozzá, és felépíti az RNS-szálat. A prokariótákban a termináció két fő terminációs stratégián keresztül történik: a Rho-függő és a Rho-független befejeződésen keresztül. A Rho faktor egy helikáz aktivitással rendelkező fehérje.
Mi az a Rho-függő felmondás?
A Rho-függő termináció a prokariótákban előforduló kétféle transzkripciós terminációs stratégia egyike. A Rho faktor egy helikáz aktivitással rendelkező fehérje.
01. ábra: Rho-függő felmondás
A Rho fehérje kötődik az RNS-transzkriptumhoz, és az RNS-polimeráz mentén 5'-3' irányban mozog, elősegítve a hidrogénkötések disszociációját a DNS-templát és az RNS-transzkriptum között. Amikor a Rho faktor eléri a transzkripciós buborékot, széthúzza a DNS/RNS hibridet, és felszabadítja a transzkriptumot a transzkripciós buborékból. Amikor ez megtörténik, leállítja az átírást.
Mi az a Rho független felmondása?
Rho független termináció a második stratégia, amely leállítja a prokarióta transzkripciót. Általában egy terminátor régiónak fordított ismétlődő szekvenciája van. Közvetlenül a fordított ismétlődő szekvencia után van egy adeninben gazdag régió (AAAA). Amikor az RNS-polimeráz előrehalad, mRNS-szekvenciát állít elő. Mivel a két régió komplementer az invertált ismétlődő szekvencia régióban, a hidrogénkötés miatt hajtű hurok szerkezetet alkot. A következő régió az Egyesült Államokban gazdag régió lesz. A hajtűszerkezet megszünteti az RNS polimeráz aktivitását.
02. ábra: Rho független felmondása
Sőt, az U-ban gazdag régiókban gyenge kölcsönhatások vannak az átirat U-bázisai és a sablon A-bázisai között. Ezek a gyenge adenin-uracil kötések destabilizálják a DNS-templátot és az RNS-transzkriptumot, és elválasztják egymást. A végén az átirat felszabadul az átírási helyről.
Mi a hasonlóság a Rho-függő és a Rho-független felmondás között?
- Rho-függő és Rho-független termináció a prokariótákban megtalálható két fő leállítási stratégia.
- Mindkét forma felszabadítja az átiratot a DNS-sablonból, hogy leállítsa a transzkripciót.
Mi a különbség a Rho-függő és a Rho-független felmondás között?
A Rho-függő terminációt egy Rho fehérje közvetíti, míg a Rho-független termináció egy hajtű hurok struktúra kialakításán keresztül történik. Tehát ez a legfontosabb különbség a Rho-függő és a Rho-független lezárás között. Ezenkívül a Rho fehérje ATP energiát használ, míg a Rho független termináció nem érinti a Rho fehérjét és nem használ ATP energiát. Ezért ez is jelentős különbség a Rho-függő és a Rho-független termináció között.
Az alábbi infografika további összehasonlításokat mutat a Rho-függő és a Rho-független termináció közötti különbséggel kapcsolatban.
Összefoglaló – Rho-függő vs Rho független felmondása
Rho-függő és Rho-független termináció a prokariótákban előforduló két fő transzkripciós terminációs mechanizmus. Egy Rho fehérje felelős a transzkripciós terminációért Rho-függő terminációban. Ezzel szemben az Rho független befejeződése a hajtű hurok szerkezetének kialakításán keresztül történik. Tehát ez a legfontosabb különbség a Rho-függő és a Rho-független befejezés között.