A legfontosabb különbség az EcoRI és a HindIII restrikciós enzimek között az, hogy az EcoRI egy E. coli-ból izolált II-es típusú restrikciós enzim, míg a HindIII egy II-es típusú restrikciós enzim, amelyet Haemophilus influenzából izolálnak.
A restrikciós enzim vagy a restrikciós endonukleáz egy olyan enzim, amely a DNS-t a DNS-molekulán belül meghatározott felismerési helyeken (restrikciós helyeken) darabokra hasítja. Ezek a restrikciós enzimek baktériumokban és archaeában találhatók. Védelmi mechanizmust biztosítanak a behatoló vírusok ellen. A restrikciós enzimeket általában öt különböző típusba sorolják: I, II, III, IV és V. Az EcoRI és a HindIII két restrikciós enzim, amelyek a II-es típusú restrikciós enzimek csoportjába tartoznak.
Mik azok az EcoRI restrikciós enzimek?
Az EcoRI egy II. típusú restrikciós enzim, amelyet E. coli fajokból izolálnak. Ez egy restrikciós enzim, amely a DNS kettős hélixeket meghatározott helyeken fragmentumokra hasítja. Az EcoRI szintén a restrikciós-módosító rendszer része. Az EcoRI volt az első enzim, amelyet eredetileg az E. coli faj RY13 törzséből izoláltak. A molekuláris biológiában restrikciós enzimként használják. Az EcoRI 4 nukleotidból álló ragadós végeket hoz létre az AATT 5'-es vég túlnyúlásával. Az EcoRI elvágja a DNS-t a G↓AATTC specifikus felismerési szekvenciánál. A CTTAA↓G palindromikus komplementer szekvenciájával rendelkezik. Ezenkívül ez a restrikciós enzim a II P típusú (palindromikus specificitás) alosztályba tartozik. Elsődleges szerkezetében az EcoRI az aktív helyén belül tartalmazza a PD. D/EXK motívumot, mint sok más restrikciós enzim.
01. ábra: EcoRI
EcoRI restrikciós enzim egy 31 kDa-os homodimer. Az α/β architektúra egy globuláris tartományát tartalmazza. Mindegyik alegység tartalmaz egy hurkot, amely kilóg a globuláris doménből, és amikor meg van kötve, körbeveszi a DNS-t. Ez az enzim kokristályosodhat azzal a szekvenciával, amelyet általában elvág. Ezenkívül az EcoRI restrikciós enzimet számos molekuláris genetikai technikában használják, beleértve a klónozást, a DNS-szűrést és a DNS in vitro körülmények közötti deléciós szakaszait.
Mik azok a HindIII restrikciós enzimek?
A HindIII egy II. típusú restrikciós enzim, amelyet Haemophilus influenza fajokból izolálnak. Hidrolízissel hasítja az AACCTT DNS palindrom szekvenciát Mg2+ kofaktor jelenlétében. Ennek a különleges szekvenciának az AA’S (5’A↓ACCTT3’ és 3’TTCGA↓A5’) közötti hasítása a DNS-molekulán 5’-es túlnyúlásokat eredményez, amelyeket ragadós végeknek nevezünk. Ez az enzim megtalálható prokarióta szervezetekben, például baktériumokban. A baktériumok ezt az enzimet védekezési mechanizmusként használják a vírusok, például a bakteriofágok ellen.
02. ábra: HindIII
Strukturálisan a HindIII homodimer. Ez egy közös szerkezeti magot tartalmaz, amely négy β-lemezből és egyetlen α-hélixből áll, mint más típusú II restrikciós enzimek. Ennek az enzimnek a molekulatömege 34,9 kDa. Ezenkívül a HindIII nagyon hasznos a modern molekuláris biológiai tudományos kísérletekben, mint például a DNS-szekvenálás és a térképezés.
Milyen hasonlóságok vannak az EcoRI és a HindIII restrikciós enzimek között?
- Az EcoRI és HindIII két restrikciós enzim, amelyek a II-es típusú restrikciós enzimek csoportjába tartoznak.
- Az EcoRI-t és a HindIII-at az 1970-es évek elején találták meg.
- Az EcoRI és HindIII egyaránt tartalmazza a PD.. D/EXK aminosavszekvencia motívumot.
- Mindkét restrikciós enzim nagyon specifikusan hasítja a DNS-t.
- Ezeknek a restrikciós enzimeknek Mg2+-ra van szükségük specifikus aktivitásukhoz kofaktorként.
- A DNS levágása után ragacsos végeket termelnek.
- Nagyon hasznos összetevői a modern molekuláris biológiai kutatásoknak.
Mi a különbség az EcoRI és a HindIII restrikciós enzimek között?
Az EcoRI egy II. típusú restrikciós enzim, amelyet E. coli fajokból izolálnak, míg a HindIII egy II. típusú restrikciós enzim, amelyet Haemophilus influenza fajokból izolálnak. Így ez a legfontosabb különbség az EcoRI és a HindIII között. Ezenkívül az EcoRI a G↓AATTC specifikus felismerési szekvenciánál, míg a HindIII az A↓ACCTT specifikus felismerési szekvenciánál vágja el a DNS-t.
Az alábbi infografika táblázatos formában mutatja be az EcoRI és a HindIII közötti különbségeket egymás melletti összehasonlítás céljából.
Összefoglaló – EcoRI vs HindIII restrikciós enzimek
Az EcoRI és HindIII két restrikciós enzim, amelyek a II.p típusú alosztályba tartoznak. Nagyon specifikusan hasítják a DNS-t. Az EcoRI egy II. típusú restrikciós enzim, amelyet E. coli fajokból izolálnak, míg a HindIII egy II. típusú restrikciós enzim, amelyet Haemophilus influenza fajokból izolálnak. Tehát ez összefoglalja az EcoRI és a HindIII közötti különbséget.
