A Shine Dalgarno és a Kozak szekvencia közötti kulcsfontosságú különbség az, hogy a Shine Dalgarno szekvencia egy riboszómális kötőhely a bakteriális és régészeti hírvivő RNS-ben, míg a Kozak szekvencia a legtöbb eukarióta hírvivő RNS fehérje transzlációs iniciációs helye.
Shine Dalgarno és Kozak szekvencia két konszenzusos szekvencia, amelyek nagyon fontosak a fordítás megkezdéséhez. A molekuláris biológiában a transzláció az a folyamat, amelynek során a citoplazmában lévő riboszómák fehérjéket szintetizálnak a transzkripciós folyamat után. A transzláció során egy mRNS-t (hírvivő RNS) dekódolnak egy riboszómában, hogy egy specifikus aminosavláncot hozzon létre a sejtmagon kívül. Jellemzően egy riboszóma indukálja a dekódolási folyamatot azáltal, hogy megkönnyíti a komplementer tRNS antikodon szekvenciák mRNS kodonokhoz való kötődését. A fordítás három szakaszban zajlik: iniciálás, megnyújtás és befejezés.
Mi az a Shine Dalgarno Sequence?
A Shine Dalgarno szekvencia egy riboszómális kötőhely a bakteriális és régészeti hírvivő RNS-ben. Általában körülbelül 8 bázisra helyezkedik el az AUG startkodontól felfelé. Ez az RNS-szekvencia segít a riboszómák toborzásában a hírvivő RNS-hez azáltal, hogy a riboszómát egy mRNS startkodonhoz igazítja. Így beindítja a fehérjeszintézist. A toborzás után a tRNS az mRNS kodonok által meghatározott sorrendben aminosavakat adhat hozzá. Ez a különleges szekvencia gyakori a baktériumokban, de ritkább az archaeákban. Ezenkívül jelen van a kloroplasztiszban és a mitokondriális transzkriptumokban is. A Shine Dalgarno sorozatot először John Shine és Lynn Dalgarno ausztrál tudósok javasolták. A hatbázisú konszenzus szekvencia az AGGAGG. Például Escherichia coliban a szekvencia AGGAGGU.
01. ábra: Shine Dalgarno Sequence
Az iniciációs hely (AUG) kiválasztása a riboszóma 30S alegysége és az mRNS-templát közötti kölcsönhatástól függ. A 30S alegység 16srRNS komponensének pirimidinben gazdag régiója a Shine Dalgarno szekvencia néven ismert purinban gazdag régióhoz kötődik, az mRNS AUG iniciációs kodonjától felfelé. Továbbá az iniciációs komplex kialakulása során ezek a komplementer nukleotidszekvenciák párosulnak, és kettős szálú RNS-struktúrát alkotnak. Ez megkönnyíti az mRNS riboszómához való kötődését oly módon, hogy az iniciációs kodon a riboszóma P helyére kerül.
Mi az a Kozak-szekvencia?
A Kozak szekvencia a legtöbb eukarióta mRNS fehérje transzlációs iniciációs helye. Ezt a sorozatot Kozak konszenzusszekvenciának is nevezik. A Kozak szekvencia az optimális szekvencia a transzláció elindításához eukariótákban. Ez a szekvencia a fehérjeszabályozás szerves része. Nagyon fontos a sejtek általános egészsége szempontjából is. Segíti a genetikai üzenetekből származó fehérjetranszláció korrigálását azáltal, hogy közvetíti a riboszóma-összeállítást és a transzláció iniciációját.
02. ábra: Kozak szekvencia
Ezt a sorozatot a felfedező tudósról, Marilyn Kozakról nevezték el. A DNS genomiális szekvenciák részletes elemzésével fedezte fel. A Kozak szekvencia 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’. A nagybetűk konzervált alapokat jelölnek, míg a kisbetűk a közös változó alapokat jelölik. Az R egy purint (adenint vagy guanint) jelöl, amely mindig ezen a helyen található.
Mi a hasonlóság a Shine Dalgarno és a Kozak Sequence között?
- Shine Dalgarno és Kozak szekvencia két konszenzus szekvencia, amelyek nagyon fontosak a fordítás kezdeményezésében.
- Mindkettő RNS-szekvencia.
- A riboszóma kisebb alegysége mindkét szekvenciához kötődik.
- Mindkét szekvencia közvetíti a megfelelő riboszóma-összeállítást és transzlációs iniciációt.
- A fehérjeszabályozás és a sejtszintű általános egészség szerves részei.
Mi a különbség a Shine Dalgarno és a Kozak Sequence között?
A Shine Dalgarno szekvencia egy riboszómális kötőhely, amely a bakteriális és régebbi hírvivő RNS-ben található, míg a Kozak szekvencia egy fehérje transzlációs iniciációs hely, amely a legtöbb eukarióta hírvivő RNS-ben található. Tehát ez a legfontosabb különbség a Shine Dalgarno és a Kozak sorozat között. Továbbá a Shine Dalgarno szekvencia 5’AGGAGGU3’, míg a Kozak szekvencia 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’.
A következő infografika táblázatos formában sorolja fel a Shine Dalgarno és a Kozak sorozat közötti különbségeket egymás melletti összehasonlítás céljából.
Összefoglaló – Shine Dalgarno vs Kozak Sequence
A Shine Dalgarno és Kozak szekvenciák két konszenzusos RNS-szekvencia, amelyek nagyon fontosak a riboszóma-összeállítás és a transzláció beindítása szempontjából. A Shine Dalgarno szekvencia egy riboszómális kötőhely a bakteriális és archaeális hírvivő RNS-ben, míg a Kozak szekvencia a legtöbb eukarióta hírvivő RNS fehérje transzlációs iniciációs helye. Így ez összefoglalja a különbséget Shine Dalgarno és Kozak sorozat között.
