A primer és a promoter közötti kulcsfontosságú különbség az, hogy a primer egy kereskedelemben szintetizált rövid DNS-szekvencia, amelyet a PCR-ben használnak a cél DNS-szekvencia amplifikálására, míg a promoter egy specifikus DNS-szekvencia, amely biztonságos kezdeti kötőhelyet biztosít az RNS számára. polimeráz és transzkripciós faktorok a transzkripció elindításához.
A primer és a promoter kétféle DNS-szekvencia. A primer egy kis DNS-fragmens, amely a polimeráz láncreakcióhoz (PCR) szükséges. Rövid nukleotidszekvenciákkal rendelkezik, amelyek komplementerek a DNS-szál határoló végével. Kétféle primer létezik, amelyek kiindulópontként szolgálnak az új DNS-szálak szintéziséhez. Ezzel szemben a promoter egy specifikus DNS-szekvencia, amely egy gén transzkripciós iniciációs helyétől felfelé helyezkedik el. Közvetlenül kölcsönhatásba lép a transzkripciós mechanizmus komponenseivel, például az RNS-polimerázzal és a transzkripciós faktorokkal a DNS-transzkripció szabályozása érdekében. Ezért az RNS-polimeráz és más transzkripciós faktorok a promoterszekvenciához kötődnek és transzkripciót indítanak el.
Mi az az alapozó?
A primerek rövid DNS-szekvenciák, amelyeket a cél-DNS-szekvenciák amplifikálására terveztek. Szerkezetileg rövid nukleotidszekvenciákkal rendelkeznek, amelyek komplementerek a DNS kettős szálak határoló végeivel. Általában körülbelül 20 nukleotid hosszúak. A PCR során a Taq polimeráz katalizálja a nukleotidok hozzáadását a már meglévő nukleotidszekvenciához. Ezért a primerek kiindulási pontként szolgálnak az új szálak szintéziséhez. A Taq polimeráz csak 5’-3’ irányban működik. Ezért a DNS-szintézis ugyanabban az 5'-3' irányban megy végbe. Mivel a DNS kétszálú, a PCR-ben kétféle primerre van szükség. Forward primerként és reverse primerként ismertek, a primer DNS-szintézis alatti megnyúlásának iránya alapján.
01. ábra: Alapozók
Az előremenő primer összekapcsolódik az antiszensz DNS-száljal, és elindítja a gén + szálának szintézisét 5'-3' irányban. Rövid nukleotidszekvenciája van, amely komplementer az antiszensz szál 3' határoló végével. A reverz primer összekapcsolódik a szensz szálal, és elindítja a kódoló szál komplementer szálának szintézisét, amely a gén 5'-3' irányú szála. Így a fordított láncindítót a kódoló szál 3' végével komplementerként tervezték. Mind a fordított, mind a forward primerek fontosak a megcélzott vagy érdekelt DNS-régiók millió-milliárd kópiáinak előállításához.
Mi az a promóter?
A promoter egy DNS-szekvencia, amely egy gén transzkripciós iniciációs helyétől felfelé vagy annak 5' végén található. Kötőhelyet biztosít az RNS-polimeráznak és bizonyos szabályozóelemeknek a gén transzkripciójának elindítása érdekében. Ez egy szabályozó szekvencia, amely egy gén be- vagy kikapcsolásához szükséges. A promoterben egy specifikus nukleotid szekvencia található. 100-1000 bázispárja lehet. A promóter megmutatja a transzkripció irányát. Sőt, jelzi azt az érzéki szálat, amelyet át kell írni.
02. ábra: Egy gén promótere
Háromféle promoter elem létezik: mag promoter, proximális promoter és disztális promoter. A magpromoter a promoter azon minimális része, amely a transzkripció elindításához szükséges. Legközelebb található a startkodonhoz. A TATA box egy konzervált régió, amely számos eukarióta magpromoterben megtalálható. A transzkripció kezdőhelyétől 25-35 bázispárral feljebb található. A proximális promoter a mag promoteréhez képest áramlási irányban található. Általában 250 bázispárral feljebb helyezkedik el a startkodontól, és elsődleges szabályozóelemeket tartalmaz. A disztális promoter a proximális promoter előtt található, és további szabályozóelemeket tartalmaz. A bakteriális promóterek promotereiben két rövid szekvenciaelem található. A TATAAT a bakteriális promoter -10-es pontján található konszenzusszekvencia, míg a TTGACA a -35-ös konszenzusszekvencia. -10 elemként és -35 elemként ismertek.
Mi a hasonlóság a Primer és a Promoter között?
- A primer és a promoter kétféle DNS-szekvencia.
- Nukleotidszekvenciákból állnak.
- Mind a primer, mind a promoter fontos a génexpresszió szempontjából.
Mi a különbség a Primer és a Promoter között?
A primer egy rövid nukleotidszekvencia, amelyet a cél-DNS amplifikálására terveztek. Ezzel szemben a promoter egy specifikus szabályozó DNS-szekvencia, amely egy gén transzkripciós iniciációs helyétől felfelé található. Tehát ez a legfontosabb különbség a primer és a promoter között. A primerek körülbelül 20 bázispár hosszúak, míg a promoter 100-1000 bázispár hosszúságú lehet. Funkcionálisan a primerek az új szálszintézis kiinduló szekvenciáiként szolgálnak, míg a promoterek szabályozzák a géntranszkripciót azáltal, hogy kötőhelyeket biztosítanak az RNS-polimeráz és más transzkripciós faktorok számára.
Sőt, a promoter a transzkripció iránya, és egy gén szensz szálát jelzi. Szerkezetileg a primer egy rövid, egyszálú DNS-szekvencia, míg a promoter egy hosszú, kétszálú DNS-szekvencia.
Az alábbi infografika további összehasonlításokat tartalmaz a primer és a promoter közötti különbséggel kapcsolatban.
Összefoglaló – Primer vs Promoter
A primerek rövid nukleotidszekvenciák, amelyek komplementerek a cél-DNS kettős szálának szegélyező végeivel. A PCR-ben kétféle primert használnak. Kiinduló szekvenciákként szolgálnak az új szálak szintéziséhez. A primereket kereskedelemben tervezték, és hőmérsékletstabil sorozatok. Másrészt a promoter egy gén szabályozó szekvenciája, amely a transzkripciós iniciációs helytől felfelé helyezkedik el. A promóterek szabályozzák a gének transzkripcióját. Kötőhelyeket biztosítanak az RNS-polimeráznak és a transzkripciós faktoroknak a transzkripció elindításához. Így ez a primer és a promoter közötti különbség összefoglalása.
