A legfontosabb különbség a proteomika és a metabolomika között az, hogy a proteomika egy szervezet összes fehérjéjét, míg a metabolomika egy szervezet összes metabolitját tanulmányozza.
A genomika egy szervezet genetikai felépítésének tanulmányozása. A proteomika és a metabolomika a genomikához kapcsolódó két ómikus tudomány. A proteom egy sejtben vagy szervezetben lévő összes fehérjére vonatkozik. A metabolom viszont egy szervezet összes metabolitjára utal. Így a proteom tanulmányozása a proteomika, míg a metabolom tanulmányozása a metabolomika. Mind a proteomika, mind a metabolomika fontos a betegségek diagnosztikájában, valamint a szervezetek jellemzésében és szűrésében. Ráadásul mindkettő a sejtbiológia számos aspektusában összefügg, különösen a sejtjelátvitelben, a fehérjelebontásban és -generálásban, valamint a transzláció utáni módosításban.
Mi az a proteomika?
A proteom a teljes fehérje-komplement egy sejtben, szövetben vagy szervezetben. Ezért a proteomika egy szervezet proteomjának tanulmányozása. A proteomikában a fehérjék különböző jellemzőit elemzik. Ezért a proteomika elsősorban a fehérjék szerkezetére, orientációjára, funkcióira, fehérje kölcsönhatásaira, módosításaira, alkalmazásaira és fontosságára összpontosít. Ezért folyik jelenleg sok kutatási projekt a proteomika területén.
Az első proteomikai vizsgálatokat az Escherichia coli fehérjetartalmának meghatározására végezték. A teljes fehérjetartalom feltérképezése kétdimenziós (2D) gélekkel történt. A projekt sikere után a tudósok rátértek az állatok, például tengerimalacok és egerek teljes fehérjetartalmának jellemzésére. Jelenleg az emberi fehérjetérképezés 2D gélelektroforézissel történik.
A proteomika tanulmányozásának számos előnye van, mivel a fehérjék katalizátor tulajdonságai miatt a fehérjék a legtöbb aktivitást irányító molekulák. Így a teljes fehérjék vizsgálata információkat szolgáltathat egy szervezet egészségi állapotáról. Ezen túlmenően a proteomikának számos alkalmazása van a genom annotációjában, a betegségek azonosításában és a diagnosztikában, a kísérletek során végzett fehérjeexpressziós vizsgálatokban, valamint a fehérjemódosításokban és interakciós vizsgálatokban stb.
01. ábra: Proteomika
A proteomikában különböző technikák szerepelnek, beleértve a teljes fehérje extrakcióját, azok szétválasztását 2D gélelektroforézissel, a kivont fehérjék szekvenálását olyan módszerekkel, mint az Edmund-féle szekvenálási módszer vagy tömegspektrometria, valamint szerkezeti és funkcionális elemzés. a fehérje tulajdonságait számítógépes szoftverek és bioinformatikai eszközök segítségével.
Mi az a metabolizmus?
A metabolizmus a sejtben, szövetben vagy szervezetben lévő összes metabolit vizsgálata. Ez magában foglalja a celluláris metabolitok azonosítását és mennyiségi meghatározását különböző fejlett analitikai és statisztikai eszközök segítségével. Az anyagcsere egy fontos tanulmány, mivel információkat tár fel a szervezet anyagcseréjéről.
02. ábra: Anyagcsere
A metabolikus reakciók szubsztrátjainak és termékeinek tanulmányozásához a metabolomika tömegspektrometriát használ analitikai platformként. A tömegspektrometria metabolitokat és azok koncentrációit eredményezi, amelyek tükrözik a sejtek vagy szövetek aktuális biokémiai állapotát. Ezért a metabolomika tekinthető a szervezet molekuláris fenotípusának legjobb reprezentációjának. Ezeken túlmenően a metabolomika a proteomika kiterjesztésének tekinthető, mivel a legtöbb metabolit olyan enzimek aktivitása miatt keletkezik, amelyek fehérjék.
Mi a hasonlóság a proteomika és a metabolizmus között?
- A proteomika és a metabolomika a genomikához kapcsolódó két ómikus tudomány.
- A metabolizmus a proteomika kiterjesztésének tekinthető.
- A proteom és a metabolom szorosan összefonódik számos tanulmánysal.
Mi a különbség a proteomika és a metabolizmus között?
A proteomika a fehérjék nagyszabású tanulmányozása, beleértve azok szerkezetét és működését, sejten vagy szervezeten belül. Eközben a metabolomika a metabolitprofilok tanulmányozása egy sejtben, szövetben vagy szervezetben adott körülmények között. Tehát ez a legfontosabb különbség a proteomika és a metabolomika között. Emellett a proteomika elsősorban a fehérjék teljes készletére vonatkozik, míg a metabolomika főként a metabolitok teljes készletére vonatkozik, beleértve a kis molekulák sokféleségét, például peptideket, szénhidrátokat, lipideket, nukleozidokat és az exogén vegyületek katabolikus termékeit stb. Ezért ez egy másik különbség a proteomika és a metabolomika között.
Az alábbi infografika összefoglalja a proteomika és a metabolomika közötti különbséget.
Összefoglaló – Proteomics vs Metabolmics
Az élő szervezetek genomjuk, fehérjeik és metabolitjaik segítségével tanulmányozhatók. A genomika, a proteomika és a metabolomika az a három terület, amely egy sejt vagy egy szervezet genetikai felépítését, fehérjéit és metabolitjait vizsgálja. A proteomika fontos, mivel a gének és a környezet dinamikus tükröződése. Az anyagcsere nagyon fontos, mivel közvetlenül tükrözi a sejtek biokémiai reakcióinak aktuális állapotát vagy a szervezet metabolikus állapotát. Így ez összefoglalja a proteomika és a metabolomika közötti különbséget.
