A legfontosabb különbség az 1D és a 2D gélelektroforézis között a fehérjék gélelektroforézis során történő elválasztására használt tulajdonságokban rejlik. Az 1D gélelektroforézis csak a molekulatömeg alapján, míg a 2D gélelektroforézis az izoelektromos pont és a molekulatömeg alapján választja el a fehérjéket.
A fehérjék gélelektroforézissel történő szétválasztása fontos módszer a fehérjék jellemzésére. A fehérjék különböző tulajdonságokkal rendelkeznek; ezért az elválasztás bonyolultabb, mint az agaróz gélelektroforézissel végzett DNS-elválasztás.
Mi az 1D gélelektroforézis?
1D Gélelektroforézis, más néven egydimenziós gélelektroforézis, a fehérjék molekulatömeg alapján történő elválasztásának módszere. A fehérjék szétválasztása elsősorban poliakrilamid gélelektroforézissel történik. A gélelektroforézis koncepciója alapján a molekulák molekulatömegük és töltésük alapján válnak szét.
A fehérjék egyenletes töltése érdekében ezért a nátrium-dodecil-szulfátos (SDS) kezelést a gélelektroforézis előtt kell elvégezni. Az SDS denaturálja a fehérjéket, és egyenletes negatív töltést biztosít a fehérjén; amikor az elektromos tér alkalmazása megtörténik, a fehérjék molekulatömegük alapján a pozitív terminálisra vándorolnak. Így az elválasztásnál csak egy tulajdonságot veszünk figyelembe. Ezért nevezik ezt a módszert 1D gélelektroforézisnek.
01. ábra: 1D gélelektroforézis
Az 1D gélelektroforézis során a fehérjéket molekulatömegük alapján választják el. Ebből a szempontból a kisebb tömegű molekulák gyorsabban vándorolnak a gélben, mint a nagy molekulatömegű fehérjék. Így a nagy tömegű fehérjék a kutak közelében maradnak.
Mi az a 2D gélelektroforézis?
A 2D gélelektroforézis vagy a kétdimenziós gélelektroforézis két tulajdonság alapján választja el a fehérjéket. A két tulajdonság a fehérje izoelektromos pontja és a molekulatömeg. Ez a fehérjeelválasztási módszer növeli a fehérjeelválasztás felbontását. A fehérje izoelektromos pontja attól a pH-tól függ, amelyen a fehérje semleges.
02. ábra: 2D gélelektroforézis
Így a 2D gélelektroforézis során a fehérjét az első dimenzióban rögzített pH-gradiensen hagyjuk futni. A második dimenzióban a fehérjéket függőleges vagy horizontális poliakrilamid gélelektroforézissel választják el. Így a fehérjék molekulatömegük szerint különülnek el a második dimenzióban.
Emellett a gélelektroforézisnek ez a módszere növeli a fehérjeleválasztás felbontását. Ezért az elválasztott fehérjék tisztábbak. A technika költsége azonban sokkal magasabb, mint az egydimenziós gélelektroforézisé.
Mi a hasonlóság az 1D és a 2D gélelektroforézis között?
- Mindkét technika elválasztja a fehérjéket.
- Ezért fontosak a fehérjék jellemzésében.
Mi a különbség az 1D és a 2D gélelektroforézis között?
A legfontosabb különbség az 1D és a 2D gélelektroforézis között az, hogy az 1D gélelektroforézis csak a molekulatömeg alapján, míg a 2D gélelektroforézis az izoelektromos pont és a molekulatömeg alapján választja el a fehérjéket. Az 1D és 2D gélelektroforézis közötti alapvető különbség miatt a fehérjék szétválasztásának felbontása és a két technika költsége is eltérő. A 2D gélelektroforézis nagyobb felbontást mutat, mint az 1D gélelektroforézis. A 2D gélelektroforézis azonban drágább, mint az 1D gélelektroforézis.
Az alábbi infografika összefoglalja az 1D és 2D gélelektroforézis közötti különbséget.
Összefoglaló – 1D vs 2D gélelektroforézis
A fehérjék szétválasztása számos tényezőtől függ. Az 1D gélelektroforézis csak a molekulatömeg alapján választja el a fehérjéket. A kétdimenziós vagy 2D gélelektroforézis azonban növeli a fehérje elválasztás felbontását. Ezenkívül a 2D gélelektroforézis az izoelektromos pont és a molekulatömeg alapján választja el a fehérjéket. Ezért ezek az adatok fontosak a fehérjék downstream feldolgozásában és a proteomika területén. Így ez az 1D és 2D gélelektroforézis közötti különbség összefoglalása.
